53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3939 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  92.48 
 
 		 135 aa  236  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  66.67 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  64.84 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  64.84 
 
 		 128 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  61.72 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  61.72 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  61.72 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  58.33 
 
 		 136 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  61.72 
 
 		 128 aa  159  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  60.16 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  59.38 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  58.59 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  55.97 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  59.38 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  60.16 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  57.36 
 
 		 134 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  53.91 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  54.4 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  57.14 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  51.94 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  52.03 
 
 		 286 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  52.03 
 
 		 286 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  47.11 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  51.22 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  27.34 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  26.6 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  26.6 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  28.12 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  29.21 
 
 		 284 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  33.75 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  30.85 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  28.41 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  26.37 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  27.74 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  28.4 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  31.82 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  26.62 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  34.29 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  30.68 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  30.11 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  26.72 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  30.68 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  31.08 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>