137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3622 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  100 
 
 		 297 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  97.98 
 
 		 297 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  78.55 
 
 		 297 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  78.89 
 
 		 297 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  74.91 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  78.2 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  78.64 
 
 		 297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  60.14 
 
 		 296 aa  311  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  59.45 
 
 		 296 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  58.82 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  60.71 
 
 		 292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  54.48 
 
 		 295 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  47.22 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  45.77 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  42.07 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  46.91 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  39.86 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  41.72 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  39.72 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  41.89 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  36.99 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  37.32 
 
 		 297 aa  165  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  32.87 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  33.81 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  30.64 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  32.36 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  34.14 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  33.45 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  30 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  30 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  33.21 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  32.23 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  34.62 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  31.5 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  33.19 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  31.5 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  31.15 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  33.9 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  31.85 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  30.8 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  30.07 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  33.58 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  31.88 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  28.72 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  33.19 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  33.1 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  32.65 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  30.07 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  31.64 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  30.04 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  31.69 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  28.98 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  33.99 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  30.15 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02093  P3 protein  33.65 
 
 		 221 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000002356  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  28.04 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  31.4 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  31.99 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  31.29 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  32.42 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  30.89 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  29.79 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  34.25 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  33.1 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  26.9 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  31.64 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  27.66 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  31.8 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  27.87 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  33.06 
 
 		 323 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  30.89 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  31.29 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  27.49 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  27.9 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  27.46 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  31.11 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  30.74 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  28 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  27.46 
 
 		 322 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  29.83 
 
 		 340 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  27.05 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  33.55 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2141  bile acid:sodium symporter  33.2 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.219683  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  26.77 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  29.78 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  27.05 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  27.05 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  31.78 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  29.3 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  28.34 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  31.64 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  27.05 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  37.5 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  29.96 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  27.08 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  31.12 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  27.88 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  29.63 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  30.17 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>