140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3611 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  675    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  96.42 
 
 
335 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  81.19 
 
 
335 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  78.51 
 
 
335 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  82.79 
 
 
308 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  63.88 
 
 
335 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  46.13 
 
 
309 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  41.67 
 
 
337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  37.54 
 
 
332 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  39.93 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  41.32 
 
 
317 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  36.06 
 
 
332 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  38.76 
 
 
338 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  39.06 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  37.46 
 
 
328 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  39.93 
 
 
332 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  38.87 
 
 
332 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  37.79 
 
 
360 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  37.79 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  37.79 
 
 
360 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  37.07 
 
 
362 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  36.73 
 
 
362 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  34.95 
 
 
356 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  34.78 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  34.71 
 
 
338 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  34.21 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  33.88 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  35.18 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  33.23 
 
 
329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  31.1 
 
 
351 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.13 
 
 
343 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  30.03 
 
 
356 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  29.18 
 
 
356 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  32.96 
 
 
330 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  28.75 
 
 
354 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  29.46 
 
 
356 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  29.46 
 
 
356 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.65 
 
 
344 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  30.1 
 
 
356 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  31.21 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  30.93 
 
 
330 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  30.97 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  30.97 
 
 
340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  30.97 
 
 
340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  30.97 
 
 
340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  30.97 
 
 
340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  30.97 
 
 
340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  28.4 
 
 
363 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.67 
 
 
385 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  30.77 
 
 
369 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  26.18 
 
 
363 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  27.42 
 
 
325 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  27.89 
 
 
361 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  28.29 
 
 
361 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  28.29 
 
 
361 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  26.21 
 
 
374 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  29.18 
 
 
336 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  30.22 
 
 
366 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  28.29 
 
 
361 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.08 
 
 
349 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  28.22 
 
 
365 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  29.69 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  27.81 
 
 
366 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  29.35 
 
 
348 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.67 
 
 
349 aa  95.9  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.29 
 
 
359 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  26.33 
 
 
366 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  26.92 
 
 
366 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  26.33 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  26.33 
 
 
366 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  26.33 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  29.81 
 
 
388 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  25.75 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  26.89 
 
 
361 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  26.37 
 
 
366 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  26.37 
 
 
366 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  26.37 
 
 
366 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  26.37 
 
 
366 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  26.37 
 
 
366 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  26.37 
 
 
366 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  26.37 
 
 
366 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  29.84 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  29.39 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  25.66 
 
 
366 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.77 
 
 
388 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  28.87 
 
 
357 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  28.67 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0022  hypothetical protein  23.55 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.411446  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.62 
 
 
364 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  28 
 
 
341 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  29.41 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  28.16 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0636  hypothetical protein  27.18 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  28.77 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  27.8 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  28.52 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  27.8 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  27.8 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  28.87 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  28.87 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>