228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3198 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  100 
 
 
409 aa  810  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  97.31 
 
 
409 aa  768  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  54.76 
 
 
421 aa  460  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  54.76 
 
 
421 aa  458  1e-128  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  55.26 
 
 
416 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  8.11517e-08 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  56.63 
 
 
421 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  53.77 
 
 
427 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  52.51 
 
 
427 aa  416  1e-115  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  53.22 
 
 
422 aa  416  1e-115  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  52.88 
 
 
412 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  50.75 
 
 
429 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  48.67 
 
 
429 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  50 
 
 
429 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  49.75 
 
 
429 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  49.64 
 
 
411 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  48.77 
 
 
417 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  48.53 
 
 
410 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  50.13 
 
 
418 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  48.53 
 
 
410 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  49.25 
 
 
410 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  48.68 
 
 
421 aa  362  7e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  49.36 
 
 
418 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  46.99 
 
 
415 aa  355  6e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  44.6 
 
 
433 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  3.30448e-05 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  50.73 
 
 
416 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.05785e-07 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  50.24 
 
 
416 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  45.5 
 
 
433 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  47.98 
 
 
416 aa  343  3e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  43.49 
 
 
433 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  47.02 
 
 
416 aa  338  1e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  43.49 
 
 
429 aa  337  2e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  43.19 
 
 
433 aa  337  3e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  45.83 
 
 
417 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  45.34 
 
 
417 aa  322  1e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  45.34 
 
 
417 aa  321  2e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  42.31 
 
 
420 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  42.75 
 
 
430 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  42.89 
 
 
420 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  44.98 
 
 
439 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  43.36 
 
 
416 aa  313  3e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  42.72 
 
 
423 aa  312  7e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  44.23 
 
 
426 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  43.16 
 
 
418 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  43.13 
 
 
416 aa  310  3e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  43.54 
 
 
417 aa  310  3e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  43.13 
 
 
416 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  41.98 
 
 
427 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  44.76 
 
 
417 aa  309  7e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  42.99 
 
 
416 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  43.24 
 
 
431 aa  308  1e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  42.96 
 
 
431 aa  307  2e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  44.63 
 
 
416 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  44.5 
 
 
418 aa  302  8e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  40.79 
 
 
463 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  40.71 
 
 
460 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  42.51 
 
 
417 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  42.78 
 
 
428 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  42.2 
 
 
422 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  43.82 
 
 
442 aa  299  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  43.52 
 
 
418 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  42.05 
 
 
408 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  42.89 
 
 
418 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  41.96 
 
 
426 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  41.13 
 
 
440 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  42.69 
 
 
418 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  42.89 
 
 
418 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  42.17 
 
 
419 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  42.89 
 
 
424 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  42.93 
 
 
395 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  42.13 
 
 
405 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  41.95 
 
 
422 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  42.39 
 
 
422 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  41.53 
 
 
440 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  42.57 
 
 
417 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  41.65 
 
 
423 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  41.9 
 
 
412 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  41.58 
 
 
423 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  41.12 
 
 
447 aa  289  5e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  40.51 
 
 
437 aa  289  5e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  41.39 
 
 
412 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  42.53 
 
 
413 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  41.34 
 
 
423 aa  288  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  41.95 
 
 
408 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  41.13 
 
 
412 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  41.65 
 
 
412 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  40.24 
 
 
439 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  40.57 
 
 
427 aa  286  3e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  42.54 
 
 
417 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  42.3 
 
 
417 aa  285  1e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  41.06 
 
 
415 aa  285  1e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  42.86 
 
 
421 aa  285  1e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  40.05 
 
 
441 aa  283  3e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  40.67 
 
 
424 aa  283  3e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  40.3 
 
 
422 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  42.64 
 
 
429 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  40.09 
 
 
439 aa  278  9e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  37.77 
 
 
420 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  38.48 
 
 
443 aa  274  2e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  40.81 
 
 
416 aa  274  2e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  40.45 
 
 
427 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>