43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3061 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  99.79 
 
 		 469 aa  962    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430191  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  100 
 
 		 469 aa  965    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2012  Homospermidine synthase  49.67 
 
 		 474 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3337  homospermidine synthase  47.41 
 
 		 471 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1354  homospermidine synthase  50.65 
 
 		 475 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  48.69 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2138  homospermidine synthase  48.49 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1345  homospermidine synthase  46.12 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0921  homospermidine synthase  46.77 
 
 		 478 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.126033  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0933  Homospermidine synthase  46.12 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4552  homospermidine synthase  44.95 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3423  homospermidine synthase  45.26 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2727  homospermidine synthase  46.04 
 
 		 481 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1078  homospermidine synthase  45.91 
 
 		 476 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2042  homospermidine synthase  45.69 
 
 		 482 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.418846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5045  homospermidine synthase  46.57 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2317  Homospermidine synthase  45.69 
 
 		 482 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102013  normal  0.442581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4834  homospermidine synthase  45.81 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5462  Homospermidine synthase  46.12 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.52008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0850  homospermidine synthase  44.4 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.369039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2003  Homospermidine synthase  45.47 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1868  homospermidine synthase  46.3 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1154  Homospermidine synthase  45.04 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00185878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0451  homospermidine synthase  45.26 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3707  homospermidine synthase  45.06 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3300  Homospermidine synthase  44.75 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3602  Homospermidine synthase  44.97 
 
 		 483 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1646  homospermidine synthase  45.81 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322403  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2688  homospermidine synthase  44.11 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4263  homospermidine synthase  43.47 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393392  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2416  hypothetical protein  43.82 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2562  hypothetical protein  43.6 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0078  homospermidine synthase  43.68 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0956  homospermidine synthase  44.9 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0073  homospermidine synthase  42.83 
 
 		 476 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2947  homospermidine synthase  43.57 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0190455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0878  Homospermidine synthase  36.89 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0694  homospermidine synthase  37.27 
 
 		 486 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1047  homospermidine synthase  34.32 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2685  homospermidine synthase  34.87 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137056  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2622  homospermidine synthase  34.17 
 
 		 481 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  21.55 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  21.18 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>