17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2893 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2893  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  274  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  96.45 
 
 		 141 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  56.55 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  56.94 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  40.2 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.51 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  31.48 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  30.56 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  30.56 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.17 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.3 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  36.27 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  32.86 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  26.92 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  27.69 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  31 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  30.21 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>