155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2891 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  99.41 
 
 
338 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  70.09 
 
 
341 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  72.06 
 
 
340 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  35.69 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5983  type VI secretion protein  34.18 
 
 
377 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  34.77 
 
 
348 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  34.77 
 
 
348 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  34.04 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  29.64 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  29.64 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  29.64 
 
 
356 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  26.49 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  30.6 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  31.6 
 
 
388 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  30.1 
 
 
328 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  30.4 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  29.64 
 
 
356 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  31.37 
 
 
367 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  29.12 
 
 
362 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.52 
 
 
343 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  30.79 
 
 
337 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  30 
 
 
336 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  27.44 
 
 
366 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.29 
 
 
344 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  28 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.24 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.48 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  29.85 
 
 
361 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  27.67 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  24.83 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  29.21 
 
 
427 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  29.09 
 
 
366 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  27.97 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  26.94 
 
 
335 aa  93.2  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.62 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.41 
 
 
359 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  30.62 
 
 
363 aa  92.4  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  28.92 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  28.92 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  28.12 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  29.25 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  28.88 
 
 
361 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  28.66 
 
 
369 aa  90.5  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  30.38 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  30.38 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  30.38 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.51 
 
 
364 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  26.99 
 
 
338 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  29.41 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  30.07 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.68 
 
 
349 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.72 
 
 
385 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.51 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  26.27 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  29.47 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.04 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  29.94 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  27.8 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  29.94 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  29.94 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  27.46 
 
 
338 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  29.07 
 
 
366 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  29.07 
 
 
366 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  29.07 
 
 
366 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  26.97 
 
 
321 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  29.07 
 
 
366 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  29.07 
 
 
366 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  29.07 
 
 
366 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  29.07 
 
 
366 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  29.94 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  29.94 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  29.94 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  27.65 
 
 
353 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.36 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  26.56 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  27.87 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  28.62 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  27.7 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  27.59 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  27.59 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  26.06 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  28.31 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  29.41 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  29.41 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  29.41 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  27.01 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  26.06 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  25.91 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  28.14 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  26.06 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  30.08 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  27 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  30.08 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  25.24 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.96 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  25.24 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  32.81 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  26.39 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>