215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2866 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  68.23 
 
 
462 aa  634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  73.66 
 
 
447 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  75 
 
 
464 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  73.99 
 
 
456 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  77.51 
 
 
450 aa  717    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  93.1 
 
 
448 aa  843    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  72.79 
 
 
448 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  100 
 
 
448 aa  908    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  68.01 
 
 
472 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  67.25 
 
 
423 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  45.57 
 
 
431 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  34.56 
 
 
402 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  33.09 
 
 
428 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  30.36 
 
 
439 aa  196  7e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  36.11 
 
 
350 aa  189  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  31.92 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  31.61 
 
 
449 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  31.3 
 
 
399 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  28.95 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  30.53 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  31.14 
 
 
392 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  28.41 
 
 
409 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  32.43 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  30.37 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  28.92 
 
 
444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  28.65 
 
 
381 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  34.31 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  29.68 
 
 
429 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  33.66 
 
 
412 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  28.05 
 
 
394 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  27.94 
 
 
412 aa  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  25.93 
 
 
602 aa  132  9e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.67 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  27.88 
 
 
413 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  26.07 
 
 
438 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  26.3 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 
346 aa  117  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  28.18 
 
 
344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.57 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  27.67 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  29.55 
 
 
348 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  26.65 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  24.59 
 
 
415 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  27 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  27.17 
 
 
420 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  24.1 
 
 
317 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  25.65 
 
 
363 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  25.74 
 
 
402 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  26.04 
 
 
313 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  27.23 
 
 
355 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  28.26 
 
 
342 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  29.7 
 
 
444 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  30.5 
 
 
333 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  27.18 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  26.65 
 
 
352 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  25.54 
 
 
360 aa  96.7  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  26.6 
 
 
352 aa  96.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  25.96 
 
 
355 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  29.53 
 
 
350 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  27.44 
 
 
353 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  25.26 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  25.26 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  26.33 
 
 
311 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  26.71 
 
 
377 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  28.83 
 
 
354 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  23.18 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  24.17 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  24.17 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  22.48 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  29.11 
 
 
307 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  24.17 
 
 
325 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  24.17 
 
 
325 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  22.48 
 
 
323 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  22.48 
 
 
323 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  33.33 
 
 
327 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  24.47 
 
 
320 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  26.4 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  21.82 
 
 
323 aa  90.1  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  23.87 
 
 
325 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  22.63 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  21.5 
 
 
323 aa  89.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  23.87 
 
 
325 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  22.8 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  21.82 
 
 
323 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  21.82 
 
 
323 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  21.82 
 
 
323 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  24.84 
 
 
323 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  24.45 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  23.1 
 
 
323 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  27.64 
 
 
311 aa  87.4  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  21.69 
 
 
323 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  21.69 
 
 
323 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  28.05 
 
 
349 aa  87  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  21.69 
 
 
323 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  21.69 
 
 
323 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  21.69 
 
 
323 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  23.56 
 
 
325 aa  87  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  22.37 
 
 
323 aa  86.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  24.8 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>