More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2864 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  95.59 
 
 
284 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  75.09 
 
 
292 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  71.48 
 
 
286 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  73.95 
 
 
301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  70.11 
 
 
303 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  66.21 
 
 
293 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  70.54 
 
 
282 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  71.21 
 
 
288 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  71.95 
 
 
246 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  42.64 
 
 
535 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  42.08 
 
 
570 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  39.86 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  39.62 
 
 
1911 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  37.33 
 
 
556 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  36.79 
 
 
338 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  39.54 
 
 
289 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  37.2 
 
 
628 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  39.68 
 
 
820 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  36.47 
 
 
654 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  35.17 
 
 
600 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  35.42 
 
 
549 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  38.28 
 
 
413 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  36.47 
 
 
657 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  38.04 
 
 
616 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  37.5 
 
 
929 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  38.05 
 
 
523 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  38.78 
 
 
291 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 
882 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  40.94 
 
 
892 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  36.26 
 
 
292 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 
698 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  36.69 
 
 
358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  38.86 
 
 
603 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  40.17 
 
 
522 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  36.65 
 
 
416 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  37.2 
 
 
740 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  34.38 
 
 
802 aa  148  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  37.27 
 
 
538 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  37.65 
 
 
269 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  39.22 
 
 
527 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  37.5 
 
 
1196 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  40.16 
 
 
862 aa  145  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  37.19 
 
 
877 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  36.14 
 
 
781 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  38.53 
 
 
636 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  35.74 
 
 
287 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 
623 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  35.63 
 
 
587 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  37.84 
 
 
664 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  37.56 
 
 
925 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  35.6 
 
 
497 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  35.08 
 
 
586 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  37.08 
 
 
654 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
637 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  36.33 
 
 
491 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  34.66 
 
 
293 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
620 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
618 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  34.26 
 
 
281 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
637 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  34.21 
 
 
1104 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
621 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  34.14 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 
593 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  34.77 
 
 
346 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 
617 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
625 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  35.11 
 
 
305 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  31.8 
 
 
611 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  32.97 
 
 
551 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  32.79 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  31.56 
 
 
277 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 
611 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
616 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 
426 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.46 
 
 
390 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  31.29 
 
 
287 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  31.52 
 
 
453 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.19 
 
 
751 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
639 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
639 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  30.43 
 
 
348 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.73 
 
 
325 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  34.63 
 
 
1132 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  30.43 
 
 
348 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  32.84 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  32.43 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  33.59 
 
 
517 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  32.88 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.68 
 
 
433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.7 
 
 
826 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.91 
 
 
554 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  33.62 
 
 
620 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
398 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  31.14 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  31.54 
 
 
584 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  30.71 
 
 
668 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  31.48 
 
 
586 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>