40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2693 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  91.39 
 
 
237 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  70.2 
 
 
214 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  64.39 
 
 
216 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  63.64 
 
 
223 aa  275  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  62.69 
 
 
216 aa  267  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  62.69 
 
 
225 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  62.75 
 
 
216 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  59.81 
 
 
223 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  60.4 
 
 
223 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  60.1 
 
 
216 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  45.55 
 
 
223 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  32.5 
 
 
215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  31.32 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  29.28 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
212 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 
212 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
212 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.72 
 
 
215 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
215 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
212 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
215 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
215 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  28.04 
 
 
212 aa  98.6  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
212 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  26.8 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 
216 aa  89  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  20.3 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  44.93 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8961  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  26.37 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  23.68 
 
 
192 aa  41.6  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0524731  hitchhiker  0.000628813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>