120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2537 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  95.88 
 
 
397 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  62.37 
 
 
391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  53.79 
 
 
393 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  53.52 
 
 
393 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  53.26 
 
 
393 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  51.7 
 
 
384 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  42.35 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  44.78 
 
 
390 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  46.82 
 
 
389 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  44.62 
 
 
390 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  45.36 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  42.39 
 
 
400 aa  243  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  43.15 
 
 
390 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  44.62 
 
 
390 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  44.62 
 
 
390 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  43.59 
 
 
390 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  38.89 
 
 
403 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  38.25 
 
 
403 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  42.01 
 
 
397 aa  216  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  37.4 
 
 
394 aa  215  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  38.04 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  45.95 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  45.95 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  40.05 
 
 
403 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  40.35 
 
 
401 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  40.41 
 
 
394 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  36.48 
 
 
409 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  36.06 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  44.1 
 
 
424 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  39.74 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  39.45 
 
 
403 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  38.15 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  40.1 
 
 
414 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  39.35 
 
 
403 aa  186  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  38.68 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  37.66 
 
 
422 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  38.87 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  38.87 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  35.48 
 
 
417 aa  182  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  40.76 
 
 
395 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  34.22 
 
 
418 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  40.1 
 
 
390 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  38.82 
 
 
413 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  38.86 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  38.56 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  36.96 
 
 
414 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  32.25 
 
 
428 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  38.93 
 
 
398 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  38.93 
 
 
398 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  38.93 
 
 
398 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  38.93 
 
 
406 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  40.05 
 
 
401 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  37.95 
 
 
401 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  38.54 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  38.19 
 
 
406 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  39.19 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  39.23 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  38.93 
 
 
398 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  38.93 
 
 
398 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  35.1 
 
 
385 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  39.19 
 
 
398 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  40.92 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  39.95 
 
 
404 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  39.29 
 
 
408 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  34.95 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  39.45 
 
 
389 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  36.09 
 
 
393 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  38.12 
 
 
442 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  37.56 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  38.12 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  38.12 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  38.12 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  38.12 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  38.12 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  36.15 
 
 
396 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  40.05 
 
 
403 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  36.41 
 
 
409 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  37.34 
 
 
399 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  35.52 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  37.6 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  36.64 
 
 
403 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  35.86 
 
 
403 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  36.04 
 
 
392 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  35.68 
 
 
397 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  39.53 
 
 
392 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  41.44 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  34.59 
 
 
403 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  34.95 
 
 
401 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  37.7 
 
 
408 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  38.42 
 
 
404 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  29.52 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  38.17 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  38.21 
 
 
398 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  35.21 
 
 
432 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  32.78 
 
 
400 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  36.76 
 
 
392 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  31.25 
 
 
388 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  34.85 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  36.24 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>