More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2530 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7071  ATPase  74.17 
 
 
607 aa  867    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2530  putative chaperone  100 
 
 
609 aa  1217    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1418  ATPase AAA-2  73.81 
 
 
607 aa  861    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5698  ATPase  72.19 
 
 
607 aa  859    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28920  putative chaperone  98.36 
 
 
627 aa  1199    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325759  hitchhiker  0.00000775064 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6411  ATPase  73.81 
 
 
607 aa  861    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2695  ATPase AAA-2 domain protein  43.93 
 
 
608 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1111  ATPase AAA-2 domain protein  43.67 
 
 
639 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.944563  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14960  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  36.87 
 
 
632 aa  360  4e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.426512  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03530  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  34.49 
 
 
674 aa  313  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.851007 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4603  ATPase  35.77 
 
 
624 aa  293  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.705883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3151  ATPase AAA-2  32.7 
 
 
634 aa  286  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000310841  unclonable  0.0000497822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1502  ATPase AAA-2  28.45 
 
 
597 aa  239  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.879409  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1608  ATPase AAA-2 domain protein  39.43 
 
 
994 aa  220  6e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000771621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  37.88 
 
 
862 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0666  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  35.6 
 
 
816 aa  214  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.483496  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  39.94 
 
 
871 aa  213  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  40.35 
 
 
865 aa  213  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  39.88 
 
 
870 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  39.35 
 
 
879 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  37.01 
 
 
791 aa  213  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0075  ATPase  39.88 
 
 
870 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0715422  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  38.46 
 
 
870 aa  212  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  40.12 
 
 
862 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  36.69 
 
 
789 aa  212  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  38.01 
 
 
855 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  36.47 
 
 
791 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  39.05 
 
 
879 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  40.68 
 
 
859 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2815  ATPase  39.31 
 
 
870 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565756  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6458  ATP-dependent chaperone ClpB  38.89 
 
 
864 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4357  ATPase  38.4 
 
 
866 aa  210  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  37.07 
 
 
810 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  38.51 
 
 
792 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  38.87 
 
 
879 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0109  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  35.43 
 
 
816 aa  208  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  39.12 
 
 
891 aa  208  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1973  ATPase  38.15 
 
 
439 aa  208  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  38.42 
 
 
879 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  38.58 
 
 
874 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  38.11 
 
 
875 aa  207  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  38.15 
 
 
846 aa  207  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  35.53 
 
 
867 aa  207  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  39.25 
 
 
812 aa  206  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  38.18 
 
 
792 aa  206  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  38.44 
 
 
874 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  38.44 
 
 
878 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2170  ATPase AAA-2 domain protein  38.33 
 
 
440 aa  205  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  38.46 
 
 
812 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  35.96 
 
 
806 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  40.53 
 
 
822 aa  205  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  38.44 
 
 
862 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  39.48 
 
 
837 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  37.01 
 
 
876 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  38.94 
 
 
820 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  37.89 
 
 
862 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12530  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  37.57 
 
 
881 aa  205  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0853333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  37.64 
 
 
837 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2225  ATPase  38.12 
 
 
867 aa  204  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00451076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  38.46 
 
 
891 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  38.51 
 
 
864 aa  204  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  38.9 
 
 
863 aa  204  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00600  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40 
 
 
875 aa  204  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  36.68 
 
 
854 aa  204  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  38.25 
 
 
878 aa  204  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  37.54 
 
 
874 aa  203  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2812  ATPase AAA-2 domain protein  36.44 
 
 
440 aa  203  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0876  ATPase  36.83 
 
 
862 aa  203  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166403 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1828  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  33.68 
 
 
815 aa  203  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  38.89 
 
 
859 aa  203  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  39.06 
 
 
866 aa  203  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  36.73 
 
 
859 aa  203  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  37.22 
 
 
867 aa  203  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  38.14 
 
 
889 aa  203  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5495  ATPase  39.51 
 
 
902 aa  203  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0570  ATP-dependent chaperone ClpB  35.43 
 
 
864 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.483614  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2625  ATP-dependent chaperone ClpB  38.14 
 
 
874 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0502533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  38.05 
 
 
868 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  39.2 
 
 
867 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  37.58 
 
 
810 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0130  ATPase AAA-2  39.43 
 
 
872 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581017  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  38.14 
 
 
874 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  36.69 
 
 
874 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  37.05 
 
 
860 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2054  ATPase  37.79 
 
 
441 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  38.51 
 
 
880 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  38.75 
 
 
871 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  38.18 
 
 
879 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  45.34 
 
 
865 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  43.7 
 
 
865 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  45.34 
 
 
865 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2577  ATPase  35.84 
 
 
440 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  39.68 
 
 
869 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  38.56 
 
 
861 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  38.65 
 
 
864 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  36.42 
 
 
811 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1823  ATPase  37.93 
 
 
860 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1039  ATPase  36.98 
 
 
873 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  38.14 
 
 
878 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  39.23 
 
 
839 aa  200  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>