74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2375 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  36.27 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  35.09 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  37.21 
 
 		 374 aa  85.9  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1526 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  32.06 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  34.26 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  33.59 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  33.96 
 
 		 1611 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  31.08 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  33.04 
 
 		 1048 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  27.03 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  34.26 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  28.12 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  35.78 
 
 		 797 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  31.71 
 
 		 138 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.34 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  29.03 
 
 		 388 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.99 
 
 		 880 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.99 
 
 		 880 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  31.78 
 
 		 431 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  33.75 
 
 		 404 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  29.82 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.19 
 
 		 398 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  27.52 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.48 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  31.19 
 
 		 398 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  26.42 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  31.68 
 
 		 1348 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  29.36 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  30.95 
 
 		 829 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  29.36 
 
 		 566 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  26.61 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  24.75 
 
 		 851 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  28.23 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.68 
 
 		 825 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  30.63 
 
 		 598 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  35 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  36 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 911 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25 
 
 		 1901 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  29.9 
 
 		 859 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  31 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  23 
 
 		 942 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.29 
 
 		 586 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  27.56 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 785 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  31.07 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  30.65 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0080  putative ATP/GTP binding protein  24.19 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1068 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  27.62 
 
 		 517 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.26 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4404  hypothetical protein  35.62 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  hitchhiker  0.00107284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 		 947 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4342  hypothetical protein  35.62 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  30.77 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  27.84 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  24.46 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  28.03 
 
 		 540 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  25.44 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  27.34 
 
 		 431 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  24.07 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  29.9 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  30.1 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 899 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  32.22 
 
 		 541 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2218  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 842 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.000600865  normal  0.100568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  30 
 
 		 552 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  25.24 
 
 		 161 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  26.55 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>