More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2321 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27440  putative transcriptional regulator  90.48 
 
 		 321 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016223  normal  0.601013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46370  Transcriptional regulator, LysR-family  67.65 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0141  LysR family transcriptional regulator  58.19 
 
 		 305 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 307 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4455  LysR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 301 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1270  LysR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4578  LysR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3381  transcriptional regulator, LysR family  53.79 
 
 		 305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750017  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0871  LysR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 302 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  45.67 
 
 		 297 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1706  transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2499  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 298 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 298 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 298 aa  248  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0459  transcriptional regulator, LysR family  41.86 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00764777  normal  0.120091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1717  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 323 aa  231  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0543  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4909  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 310 aa  212  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6199  transcriptional regulator, LysR family  39.15 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1887  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337699  normal  0.210949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3528  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5091  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 328 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.269776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2839  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2067  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2136  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.14 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  31.61 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1595  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2395  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0563871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3500  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0910886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  29.01 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0214  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000152565  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4123  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000527418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  28.62 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3805  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.829403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3734  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457361 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1145  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.415034 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3932  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00420556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.03 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>