More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2170 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2170  putative phosphodiesterase  100 
 
 
240 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  97.92 
 
 
240 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2107  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  83.33 
 
 
240 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  83.68 
 
 
240 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1604  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  84.39 
 
 
239 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  82.85 
 
 
240 aa  407  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2152  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  81.51 
 
 
238 aa  397  1e-110  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  81.17 
 
 
240 aa  397  1e-110  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3590  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  81.51 
 
 
238 aa  397  1e-110  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1669  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  81.93 
 
 
238 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1693  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  80.25 
 
 
238 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1922  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41 
 
 
257 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.35 
 
 
241 aa  130  2e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.19 
 
 
241 aa  129  4e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0662  glycerophosphodiester phosphodiesterase  38.55 
 
 
304 aa  127  2e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0956645  normal  0.017312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.78 
 
 
241 aa  126  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.07 
 
 
241 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.07 
 
 
241 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.63 
 
 
241 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.63 
 
 
241 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  32.33 
 
 
241 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.63 
 
 
241 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  32.91 
 
 
241 aa  120  1e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.35 
 
 
241 aa  120  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0112  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.08 
 
 
260 aa  113  2e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.89 
 
 
247 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.63 
 
 
238 aa  112  7e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4010  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.99 
 
 
242 aa  112  7e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
276 aa  111  1e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2863  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.8 
 
 
242 aa  110  1e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.22 
 
 
239 aa  109  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2228  hypothetical protein  31.47 
 
 
239 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4391  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.45 
 
 
242 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.45 
 
 
242 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4189  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.57 
 
 
242 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1026e-15 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3912  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
242 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.22775e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2200  hypothetical protein  31.47 
 
 
239 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4299  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.57 
 
 
242 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.937332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5255  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.85 
 
 
263 aa  108  8e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.38 
 
 
242 aa  108  9e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3921  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.15 
 
 
242 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0201404  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.91 
 
 
245 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.84 
 
 
257 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4241  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.15 
 
 
242 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.419754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.85 
 
 
245 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.3 
 
 
243 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.95679e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.49 
 
 
632 aa  105  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.39686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  25.97 
 
 
238 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.62 
 
 
236 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.77 
 
 
594 aa  102  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27 
 
 
247 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5469  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.04 
 
 
254 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.57 
 
 
256 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0955  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.41 
 
 
242 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  hitchhiker  0.00375744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4279  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.49 
 
 
242 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.97 
 
 
244 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.86 
 
 
240 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.6 
 
 
235 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0230  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.65 
 
 
276 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.77 
 
 
289 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0614299  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
259 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2746  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.62 
 
 
253 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.813448  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.19 
 
 
257 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1875  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.9 
 
 
254 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4506  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.54 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0238  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.77 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.03 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1509  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.19 
 
 
242 aa  99  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  29.79 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.06 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0090  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.63 
 
 
607 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0513  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.76 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.63 
 
 
607 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2341  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.15 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0083656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.87 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.957647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.63 
 
 
607 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.76 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2904  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.46 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  6.0141e-05 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.33 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1855  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.86 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.49147e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  32.77 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.11179e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1000  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.38 
 
 
242 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0943134  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.28 
 
 
265 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.0753834 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0027  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.56 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2523  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase UgpQ, putative  26.56 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0212323  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0027  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.56 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0129  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.54 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0220  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.65 
 
 
254 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0996  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.67 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.45 
 
 
227 aa  95.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3857  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.02 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0915  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.33 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0266  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.26 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3752  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.76 
 
 
238 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00938184  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.96 
 
 
224 aa  94.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.55 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.24371e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2682  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.97 
 
 
287 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05547e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.75 
 
 
607 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.16 
 
 
291 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.47655e-07 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1364  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.96 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  6.43821e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>