More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2093 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  100 
 
 
207 aa  414  1e-115  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  98.07 
 
 
207 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4515  two component LuxR family transcriptional regulator  59.13 
 
 
208 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  58.65 
 
 
212 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  59.13 
 
 
208 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  59.13 
 
 
208 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  58.49 
 
 
208 aa  258  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  58.45 
 
 
205 aa  253  1e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  57.49 
 
 
206 aa  253  2e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  57.97 
 
 
205 aa  253  2e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  57.97 
 
 
207 aa  253  2e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  56.8 
 
 
236 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  56.8 
 
 
207 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  56.8 
 
 
207 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  57 
 
 
208 aa  243  2e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  59.72 
 
 
209 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.36161e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  59.72 
 
 
209 aa  241  8e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  54.59 
 
 
207 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  54.59 
 
 
207 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  54.63 
 
 
207 aa  225  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.68 
 
 
208 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 
204 aa  181  5e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
210 aa  181  9e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 
232 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  45.67 
 
 
209 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  44.13 
 
 
220 aa  171  6e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  7.81929e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
213 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
212 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1863  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
209 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 
213 aa  164  7e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
204 aa  162  5e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  40.29 
 
 
210 aa  161  8e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 
210 aa  161  8e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3412  LuxR family DNA-binding response regulator  42.72 
 
 
204 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
209 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  39.81 
 
 
210 aa  158  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 
204 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  40.76 
 
 
210 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  40.76 
 
 
210 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  40.76 
 
 
210 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  39.52 
 
 
210 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  39.52 
 
 
210 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02240  hypothetical protein  39.11 
 
 
204 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1300  DNA-binding transcriptional activator EvgA  39.11 
 
 
204 aa  151  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2519  DNA-binding transcriptional activator EvgA  39.11 
 
 
204 aa  151  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2655  DNA-binding transcriptional activator EvgA  39.11 
 
 
204 aa  151  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1288  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 
204 aa  151  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2506  DNA-binding transcriptional activator EvgA  39.11 
 
 
204 aa  151  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00265649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02279  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EvgS  39.11 
 
 
204 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3600  DNA-binding transcriptional activator EvgA  39.11 
 
 
204 aa  151  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0441797 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  38.16 
 
 
210 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 
210 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  38.16 
 
 
210 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  38.16 
 
 
210 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.16 
 
 
210 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  38.16 
 
 
210 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  38.16 
 
 
210 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  38.16 
 
 
210 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2738  DNA-binding transcriptional activator EvgA  38.61 
 
 
204 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  38.97 
 
 
210 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 
202 aa  144  7e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0462  transcriptional regulator FimZ  37.44 
 
 
199 aa  141  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.739138  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1808  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
207 aa  140  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000516369  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
203 aa  139  2e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 
215 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
206 aa  137  9e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
212 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
209 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.8 
 
 
209 aa  135  3e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  39.13 
 
 
210 aa  135  3e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  38.65 
 
 
210 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  37.8 
 
 
209 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
216 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 
216 aa  132  2e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.64 
 
 
224 aa  133  2e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
213 aa  132  4e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
218 aa  131  7e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 
212 aa  131  8e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  33.18 
 
 
224 aa  130  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  33.18 
 
 
224 aa  130  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 
217 aa  130  1e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
211 aa  130  1e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
224 aa  130  1e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
211 aa  129  2e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  34.72 
 
 
214 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  34.72 
 
 
214 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  33.01 
 
 
214 aa  128  8e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
213 aa  127  1e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
208 aa  127  1e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 
230 aa  126  2e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  32.54 
 
 
214 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 
218 aa  125  4e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0522  LuxR response regulator receiver  37.25 
 
 
212 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000276468  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 
218 aa  123  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
216 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
211 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 
215 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
215 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
226 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  32.08 
 
 
215 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>