210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2063 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  84.01 
 
 		 974 aa  1511    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  100 
 
 		 954 aa  1871    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  37.37 
 
 		 637 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  29.01 
 
 		 965 aa  197  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  37.02 
 
 		 636 aa  195  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  33.9 
 
 		 970 aa  193  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  33.69 
 
 		 998 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  28.69 
 
 		 909 aa  189  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.3 
 
 		 1004 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.07 
 
 		 1125 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  33.12 
 
 		 970 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  33.41 
 
 		 949 aa  183  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  29.22 
 
 		 1055 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  30.82 
 
 		 1028 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  25.38 
 
 		 1033 aa  174  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.91 
 
 		 947 aa  174  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.46 
 
 		 915 aa  173  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.49 
 
 		 991 aa  167  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  29.22 
 
 		 1038 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  32.33 
 
 		 671 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.11 
 
 		 926 aa  163  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.64 
 
 		 910 aa  164  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.92 
 
 		 995 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  28.19 
 
 		 942 aa  161  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.86 
 
 		 1001 aa  157  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  28.38 
 
 		 983 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.81 
 
 		 1134 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.45 
 
 		 913 aa  152  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.11 
 
 		 906 aa  147  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.18 
 
 		 1001 aa  145  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25.64 
 
 		 1156 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  38.65 
 
 		 911 aa  127  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.96 
 
 		 710 aa  125  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.56 
 
 		 1154 aa  125  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  29.37 
 
 		 1006 aa  124  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.46 
 
 		 1179 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  28.76 
 
 		 959 aa  110  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  24.93 
 
 		 995 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  24.57 
 
 		 986 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  27.96 
 
 		 1129 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  29.1 
 
 		 1131 aa  105  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  29.1 
 
 		 1131 aa  105  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  29.1 
 
 		 1131 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  29.1 
 
 		 1131 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  29.1 
 
 		 1131 aa  105  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  28.36 
 
 		 1129 aa  104  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  28.69 
 
 		 1446 aa  104  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  34.49 
 
 		 1325 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  28.53 
 
 		 1121 aa  102  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  28.09 
 
 		 1130 aa  97.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  32.34 
 
 		 1177 aa  91.3  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  39.39 
 
 		 641 aa  90.1  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  49 
 
 		 683 aa  89.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  27.14 
 
 		 1175 aa  89  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  42.19 
 
 		 652 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  42.19 
 
 		 652 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.86 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.27 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  37.4 
 
 		 657 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.15 
 
 		 979 aa  80.1  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  39.69 
 
 		 653 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.9 
 
 		 754 aa  80.1  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  39.69 
 
 		 653 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  41.23 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  36.62 
 
 		 1053 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.91 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.94 
 
 		 634 aa  77.4  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.99 
 
 		 1011 aa  77.4  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.38 
 
 		 577 aa  73.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.81 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.46 
 
 		 770 aa  69.3  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2302  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.5 
 
 		 959 aa  69.3  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.676415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.36 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  35.97 
 
 		 1041 aa  65.1  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  35.97 
 
 		 1041 aa  65.1  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.56 
 
 		 682 aa  64.3  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.14 
 
 		 627 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.71 
 
 		 595 aa  63.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  26.34 
 
 		 644 aa  62  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  28.35 
 
 		 485 aa  62  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.5 
 
 		 627 aa  61.6  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3547  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.03 
 
 		 556 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.25 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1791  serine protease  25.63 
 
 		 1066 aa  59.7  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0261515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  27.24 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.84 
 
 		 1052 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.1 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4620  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.24 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0849966  hitchhiker  0.0030964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1188  FHA domain-containing protein  27.78 
 
 		 541 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00110568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  29.86 
 
 		 763 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8473  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.46 
 
 		 417 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1151  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.02 
 
 		 449 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0797814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.32 
 
 		 509 aa  57  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  33.1 
 
 		 533 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.53 
 
 		 1239 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  28.57 
 
 		 576 aa  55.8  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.07 
 
 		 653 aa  55.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5144  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.9 
 
 		 464 aa  55.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.86 
 
 		 640 aa  55.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>