99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2018 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  89.1 
 
 		 924 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  100 
 
 		 927 aa  1802    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  45.74 
 
 		 946 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  42.37 
 
 		 911 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  41.33 
 
 		 911 aa  492  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  48.09 
 
 		 883 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  66.93 
 
 		 931 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  46.5 
 
 		 947 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  46.8 
 
 		 948 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  48.05 
 
 		 896 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  55.01 
 
 		 912 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  35.31 
 
 		 1245 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  33.98 
 
 		 1057 aa  319  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.87 
 
 		 914 aa  313  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  39.33 
 
 		 888 aa  226  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1036 aa  222  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1041 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  30.86 
 
 		 828 aa  183  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  29.89 
 
 		 819 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  49.78 
 
 		 717 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  46.84 
 
 		 681 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  48.62 
 
 		 692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  46.7 
 
 		 737 aa  172  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  46.12 
 
 		 683 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.98 
 
 		 744 aa  165  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  27.99 
 
 		 877 aa  161  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  28.93 
 
 		 897 aa  153  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  31.87 
 
 		 889 aa  153  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  31.3 
 
 		 806 aa  151  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  30.57 
 
 		 940 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  31.82 
 
 		 918 aa  147  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  31.52 
 
 		 885 aa  147  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  54.2 
 
 		 595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  31.73 
 
 		 962 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  30.47 
 
 		 968 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  30.79 
 
 		 959 aa  139  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  31.57 
 
 		 640 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  30.6 
 
 		 1027 aa  134  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  37.14 
 
 		 826 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  30.38 
 
 		 822 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  32.57 
 
 		 658 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  32.42 
 
 		 870 aa  129  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  27.66 
 
 		 938 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  36.4 
 
 		 673 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  31.25 
 
 		 679 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  32.69 
 
 		 279 aa  106  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  39.72 
 
 		 640 aa  94.4  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  25.65 
 
 		 715 aa  89  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  32.31 
 
 		 964 aa  85.9  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  36.17 
 
 		 969 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  29.8 
 
 		 722 aa  82.8  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  29.8 
 
 		 731 aa  82.4  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1162 aa  74.3  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  31.25 
 
 		 937 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  27.85 
 
 		 895 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  34.36 
 
 		 933 aa  72.4  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  27.42 
 
 		 945 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1129 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1124 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1115 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  36.04 
 
 		 1135 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1273 aa  64.3  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  38.83 
 
 		 1359 aa  64.3  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  35.26 
 
 		 952 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  25.43 
 
 		 1454 aa  62.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  36.73 
 
 		 1247 aa  61.6  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  34.06 
 
 		 883 aa  60.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  21.88 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  34.75 
 
 		 957 aa  60.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1110 aa  58.9  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  32.08 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1566  hypothetical protein  45.61 
 
 		 539 aa  57.4  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.3 
 
 		 472 aa  57.4  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  45.76 
 
 		 1761 aa  57.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  25 
 
 		 1482 aa  57  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  47.27 
 
 		 1408 aa  55.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1565  hypothetical protein  31.67 
 
 		 601 aa  55.5  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  22.5 
 
 		 336 aa  55.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  29.86 
 
 		 604 aa  54.7  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1406  hypothetical protein  43.86 
 
 		 531 aa  54.7  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.155703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  38.96 
 
 		 1621 aa  54.7  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  32.48 
 
 		 349 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1056  hypothetical protein  38.1 
 
 		 312 aa  52.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.802166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1097 aa  53.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  32.48 
 
 		 349 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0955  hypothetical exported membrane associated protein  38.1 
 
 		 312 aa  52.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0306729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  22.93 
 
 		 323 aa  52  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  44.07 
 
 		 392 aa  48.9  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  36.67 
 
 		 364 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  35.05 
 
 		 391 aa  48.1  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  39.74 
 
 		 364 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  44.26 
 
 		 384 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  44.26 
 
 		 386 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  52.27 
 
 		 1148 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  52.27 
 
 		 1143 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  52.27 
 
 		 1149 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  52.27 
 
 		 1147 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3369  peptidoglycan-binding LysM  26.29 
 
 		 598 aa  45.8  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  46.81 
 
 		 882 aa  44.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>