197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1913 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  97.76 
 
 
312 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  59.94 
 
 
312 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  58.33 
 
 
305 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  56.09 
 
 
312 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  54.49 
 
 
312 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  54.49 
 
 
312 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  53.85 
 
 
312 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  54.63 
 
 
313 aa  345  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  53.67 
 
 
313 aa  344  8.999999999999999e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  51.92 
 
 
312 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  39.35 
 
 
312 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  40.63 
 
 
308 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  39.05 
 
 
308 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  38.73 
 
 
308 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  36.42 
 
 
313 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  40.13 
 
 
308 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  34.31 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  30.07 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  30.99 
 
 
312 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  31.49 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  29.28 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  32.92 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  31.46 
 
 
319 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  29.72 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.72 
 
 
321 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  32.82 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  30.35 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  33.12 
 
 
360 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  29.05 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  30.41 
 
 
579 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  28.09 
 
 
331 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  27.07 
 
 
357 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  31.11 
 
 
301 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  31.17 
 
 
360 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  31.17 
 
 
360 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  26.47 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  32.69 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.47 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.23 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  26.78 
 
 
353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  32.23 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  28.62 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  35.45 
 
 
359 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  35.79 
 
 
359 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  26.1 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  30 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.55 
 
 
331 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  28.48 
 
 
307 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  26.49 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  26.43 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.9 
 
 
296 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.9 
 
 
296 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.38 
 
 
296 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  33.5 
 
 
378 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  36.13 
 
 
312 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  28.9 
 
 
310 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  36.13 
 
 
312 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  26.35 
 
 
456 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  28.35 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  28.17 
 
 
458 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  27.39 
 
 
289 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  31.44 
 
 
455 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.45 
 
 
275 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.32 
 
 
292 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  25.73 
 
 
310 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  28.84 
 
 
307 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  28.37 
 
 
307 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  31 
 
 
304 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  30.45 
 
 
326 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  29.6 
 
 
458 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  32.73 
 
 
367 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  28.11 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  25.89 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  32.28 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  32.28 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  34.86 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  33.17 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  28.24 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  23.53 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  33.17 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  39.66 
 
 
398 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  31.22 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  24.52 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  25.16 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  26.84 
 
 
322 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  26.91 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  38.79 
 
 
390 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  25.61 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  38.79 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  26.84 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  25.97 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  31.32 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  24.84 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  24.13 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  26.67 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  25.87 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  25.87 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>