118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1800 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  96 
 
 
151 aa  269  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  46.76 
 
 
178 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  49.63 
 
 
184 aa  113  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  46.43 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  46.94 
 
 
156 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  46.94 
 
 
156 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  44.14 
 
 
148 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  48.61 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  50.72 
 
 
172 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  50.39 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  42.76 
 
 
172 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  43.75 
 
 
172 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  41.91 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  44.53 
 
 
172 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  39.86 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  42.76 
 
 
148 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  39.01 
 
 
162 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  43.07 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  43.17 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  40.43 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  32.17 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  46.67 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  42.96 
 
 
176 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  35.14 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  39.84 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  33.11 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  33.11 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  33.11 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  37.4 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  38.89 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  39.2 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  31.25 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  37.06 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  33.86 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  38.1 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  39.86 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  38.4 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  37.06 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  34.96 
 
 
317 aa  70.5  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  31.69 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  37.59 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  41.28 
 
 
178 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  40.46 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  35.56 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  34.92 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  36.23 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  36.96 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  40.37 
 
 
170 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  34.92 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  31.82 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  29.05 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  35.48 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  35.48 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  37.6 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  35.48 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  34.88 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  34.88 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  37.67 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  38.36 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  38.36 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  33.59 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  30.28 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  33.1 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  32.37 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  35.94 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  38.73 
 
 
167 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  33.1 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  37.39 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  31.93 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  29.69 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  31.45 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  30.5 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  36.11 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  33.87 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  32.35 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  32.54 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.48 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  33.06 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5702  hypothetical protein  34.21 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  35.53 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  31.76 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  31.25 
 
 
297 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  32.54 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  31.33 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2291  hypothetical protein  40.51 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  26.57 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  29.41 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  33.82 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  32.03 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  32.95 
 
 
313 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  32.95 
 
 
313 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  27.5 
 
 
309 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  27.5 
 
 
309 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  27.78 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  30.47 
 
 
305 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>