31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1743 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  234  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  87.5 
 
 
121 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  74.8 
 
 
123 aa  156  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  70.16 
 
 
126 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  63.2 
 
 
125 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  70.59 
 
 
119 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  63.11 
 
 
134 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  68.38 
 
 
128 aa  140  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  62.07 
 
 
120 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  56.3 
 
 
119 aa  127  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  62.04 
 
 
123 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2217  hypothetical protein  68.6 
 
 
136 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.409261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  69.17 
 
 
123 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  49.58 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  67.5 
 
 
123 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  50.42 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  47.9 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3169  hypothetical protein  69.17 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  53.92 
 
 
125 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  41.18 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  45 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  43.33 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  46.39 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  41.38 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  37.9 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  40.82 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  29.52 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  35.29 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  38.64 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  33.09 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  39.6 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>