More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1702 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  73.02 
 
 		 476 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  73.02 
 
 		 468 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  70.24 
 
 		 468 aa  666    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  73.02 
 
 		 475 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  935    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  73.02 
 
 		 468 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  93.59 
 
 		 468 aa  855    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  73.08 
 
 		 475 aa  672    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  45.52 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  47.78 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  47.86 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 466 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  43.21 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  45.34 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  43.35 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 474 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 473 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  43.43 
 
 		 462 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  42.2 
 
 		 460 aa  302  9e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  42.2 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  41.89 
 
 		 460 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 		 462 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  39.35 
 
 		 460 aa  289  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 		 454 aa  286  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 		 460 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  41.19 
 
 		 460 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  39.47 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 462 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 460 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  37.86 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 464 aa  249  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 456 aa  195  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  34.66 
 
 		 463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  34.59 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.48 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  31.92 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.77 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.71 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  33.11 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 521 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.71 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.25 
 
 		 465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  32.02 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  29.78 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  29.75 
 
 		 466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  32.27 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 464 aa  150  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 443 aa  149  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  31.99 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  28.02 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  32.91 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 429 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 429 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  29.15 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  29.15 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>