More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1693 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1693  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19670  LysR family transcriptional regulator  98.32 
 
 		 297 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.663565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  73.2 
 
 		 295 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4611  LysR family transcriptional regulator  71.72 
 
 		 293 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  70.69 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  51.26 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  45.67 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  45.67 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 293 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.44 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0420  LysR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0340  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0324  LysR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2922  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3760  transcriptional regulator, LysR family  44.14 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0176  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 334 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0974  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.966458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3390  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0953  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0988  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 296 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 308 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4084  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1046  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0884  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000164987  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0921  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1336  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.916876  normal  0.272272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  40.56 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  40.56 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  40.56 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1401  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.025944 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  40.56 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  40.56 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3051  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000517942  normal  0.0334887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3026  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1795  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00491108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4429  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353494  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0828  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 295 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0901  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000228882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0894  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2928  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0645759  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  28.77 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0243  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0291  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1324  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  33.9 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 307 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 302 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>