More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1680 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
249 aa  493  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  98.8 
 
 
249 aa  487  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  71.89 
 
 
243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 
232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  58.7 
 
 
237 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  59.02 
 
 
273 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  57.14 
 
 
270 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  57.14 
 
 
270 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  55.92 
 
 
270 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  51.39 
 
 
245 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  56.36 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 
284 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  48.19 
 
 
245 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  48.71 
 
 
255 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  49.58 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  44.96 
 
 
251 aa  198  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  45.85 
 
 
298 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  47.9 
 
 
285 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  48.39 
 
 
281 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  46.64 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 
251 aa  194  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.81 
 
 
281 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.2 
 
 
281 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  46.41 
 
 
261 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  44.83 
 
 
259 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  47.83 
 
 
278 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  45.28 
 
 
262 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  46.46 
 
 
281 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  46.46 
 
 
281 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  46.34 
 
 
261 aa  191  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  46.46 
 
 
281 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 
251 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  49.21 
 
 
249 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.27 
 
 
265 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 
279 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  48.68 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  48.72 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 
279 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  48.61 
 
 
267 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  49.77 
 
 
252 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  49.07 
 
 
262 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.39 
 
 
287 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  43.39 
 
 
251 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.39 
 
 
251 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.39 
 
 
251 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  47.74 
 
 
252 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.96 
 
 
260 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  48.03 
 
 
259 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  47.69 
 
 
269 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  45.76 
 
 
269 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  47.6 
 
 
259 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.98 
 
 
251 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  46.46 
 
 
271 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  49.34 
 
 
297 aa  184  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  49.78 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  42.29 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  47.22 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  43.97 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  44.4 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  47.79 
 
 
287 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  41.63 
 
 
247 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4965  ABC transporter related  49.54 
 
 
253 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  47.81 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  47.66 
 
 
288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
277 aa  178  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  47.77 
 
 
287 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.35 
 
 
262 aa  178  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.15 
 
 
251 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.5 
 
 
326 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.54 
 
 
253 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.86 
 
 
304 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  45.8 
 
 
261 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 
261 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.42 
 
 
304 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.4 
 
 
270 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.24 
 
 
254 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.88 
 
 
267 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  42.19 
 
 
272 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  43.78 
 
 
258 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.05 
 
 
245 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  39.76 
 
 
265 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.65 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  45.11 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3440  ABC transporter related  46.89 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  45.41 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  39.44 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.58 
 
 
275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  43.78 
 
 
303 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  44.58 
 
 
273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  44.58 
 
 
273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  45.89 
 
 
263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  41.08 
 
 
244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0101  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter ATPase  43.93 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435899  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  44.58 
 
 
273 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.44 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  44.98 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>