More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1621 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  100 
 
 
321 aa  643  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  95.02 
 
 
321 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  64.5 
 
 
300 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  70.14 
 
 
315 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  63.57 
 
 
302 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  61.02 
 
 
313 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  61.29 
 
 
317 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  62.34 
 
 
308 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  68 
 
 
301 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  60.38 
 
 
324 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  38.75 
 
 
296 aa  201  2e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  37.06 
 
 
322 aa  179  6e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 
309 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  29.5 
 
 
290 aa  139  5e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  29.15 
 
 
289 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  28.28 
 
 
287 aa  137  3e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  28.77 
 
 
289 aa  137  3e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  31.11 
 
 
294 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  29.43 
 
 
289 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  30.94 
 
 
294 aa  134  2e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  26.28 
 
 
291 aa  132  1e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  27.89 
 
 
289 aa  130  2e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.40538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  27.89 
 
 
289 aa  130  2e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.67219e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  29.06 
 
 
286 aa  131  2e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  27.89 
 
 
289 aa  130  2e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.49804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  27.89 
 
 
289 aa  130  2e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.20218e-09  hitchhiker  1.31905e-07 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  31.37 
 
 
294 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.08227e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  27.55 
 
 
290 aa  129  8e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.91416e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
289 aa  129  8e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.9607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  27.55 
 
 
290 aa  128  1e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.3368e-07  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.55 
 
 
290 aa  127  2e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.19929e-09  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  27.88 
 
 
297 aa  125  8e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.46772e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  29.55 
 
 
289 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.4464e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  29.35 
 
 
292 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  25.66 
 
 
289 aa  122  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  29.97 
 
 
304 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  27.56 
 
 
293 aa  117  4e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.66037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  28.9 
 
 
303 aa  112  8e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  28.35 
 
 
293 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  30 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  27.82 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  24.18 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  24.19 
 
 
295 aa  82.4  8e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.59 
 
 
656 aa  79  1e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  37.07 
 
 
670 aa  77.8  2e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
498 aa  78.2  2e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  47.83 
 
 
490 aa  75.9  8e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  36.52 
 
 
1313 aa  75.5  1e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
306 aa  75.1  1e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40 
 
 
266 aa  73.6  4e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 
543 aa  73.2  6e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 
638 aa  73.2  6e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
231 aa  72.8  7e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 
230 aa  72.8  8e-12  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 
506 aa  72.4  9e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 
544 aa  72.4  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  33.33 
 
 
510 aa  72  1e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.65 
 
 
542 aa  71.2  2e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.11 
 
 
294 aa  70.9  3e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  35.4 
 
 
424 aa  70.5  4e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 
224 aa  70.1  5e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  36.54 
 
 
222 aa  68.9  1e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  35.48 
 
 
214 aa  68.6  1e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.54 
 
 
220 aa  68.2  2e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.2 
 
 
248 aa  68.2  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
220 aa  68.2  2e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 
1755 aa  67.8  2e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 
225 aa  68.6  2e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  41 
 
 
310 aa  67.4  3e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  67.4  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
220 aa  67.4  3e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  41 
 
 
310 aa  67.4  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 
679 aa  67.4  3e-10  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 
630 aa  67.4  3e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  67.4  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  40.59 
 
 
311 aa  67.4  3e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  67.4  3e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  37.5 
 
 
220 aa  67  4e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  32.06 
 
 
537 aa  67  4e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.78 
 
 
320 aa  67.4  4e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  67  4e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  36.79 
 
 
226 aa  67  4e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  26.53 
 
 
324 aa  67  4e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
220 aa  67  4e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  34.64 
 
 
569 aa  66.6  5e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 
221 aa  66.6  5e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  66.6  5e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 
459 aa  67  5e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 
204 aa  66.6  5e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 
193 aa  66.6  5e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 
221 aa  66.6  5e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 
206 aa  66.2  6e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.79 
 
 
525 aa  66.2  7e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  33.33 
 
 
517 aa  66.2  7e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 
206 aa  66.2  7e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  49.32 
 
 
240 aa  66.2  7e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  49.32 
 
 
236 aa  66.2  7e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  30.17 
 
 
890 aa  66.2  7e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 
658 aa  66.2  8e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 
239 aa  65.9  8e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>