More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1611 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  64.68 
 
 
1001 aa  1254  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  66.5 
 
 
983 aa  1325  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  94.87 
 
 
995 aa  1885  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  65.16 
 
 
1001 aa  1276  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  44.7 
 
 
1038 aa  741  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  46.82 
 
 
1028 aa  814  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  3.68637e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  43.87 
 
 
1055 aa  743  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  100 
 
 
991 aa  1989  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  39.96 
 
 
1033 aa  625  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  39.38 
 
 
1004 aa  612  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  52.34 
 
 
1129 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  52.34 
 
 
1131 aa  489  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  52.34 
 
 
1131 aa  489  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  52.15 
 
 
1131 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  52.34 
 
 
1131 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  52.34 
 
 
1131 aa  489  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  52.34 
 
 
1129 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  51.96 
 
 
1130 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.65 
 
 
1125 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  34.92 
 
 
995 aa  320  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  34.27 
 
 
986 aa  313  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.59 
 
 
1119 aa  312  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  37.39 
 
 
1508 aa  295  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  36.84 
 
 
4238 aa  294  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  36.84 
 
 
3822 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  36.67 
 
 
4238 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  36.19 
 
 
3506 aa  287  6e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  37.07 
 
 
3954 aa  287  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.77 
 
 
919 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.83 
 
 
972 aa  277  9e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  36.72 
 
 
1550 aa  274  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.43 
 
 
1029 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.19 
 
 
1011 aa  272  3e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  36.47 
 
 
2365 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  37.71 
 
 
2396 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.22 
 
 
1227 aa  266  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  37.31 
 
 
2371 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  36.62 
 
 
2346 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  37.31 
 
 
2366 aa  265  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  1.66918e-09 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  33.21 
 
 
650 aa  258  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  34.36 
 
 
990 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.34 
 
 
1285 aa  245  2e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.86 
 
 
1848 aa  241  7e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  33.85 
 
 
2003 aa  234  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.32 
 
 
1881 aa  234  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  35.27 
 
 
1782 aa  232  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  32.04 
 
 
1519 aa  221  4e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  32.5 
 
 
1164 aa  220  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  32.09 
 
 
677 aa  209  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  33.93 
 
 
1053 aa  209  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  29.04 
 
 
1006 aa  207  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  30.78 
 
 
1056 aa  204  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  32.69 
 
 
994 aa  202  2e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  30.28 
 
 
985 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  30.32 
 
 
1333 aa  191  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  30.82 
 
 
1062 aa  190  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  34.57 
 
 
1016 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.14 
 
 
913 aa  180  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.92 
 
 
915 aa  179  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  30.29 
 
 
1152 aa  176  2e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.95 
 
 
906 aa  170  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  4.19199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.41 
 
 
910 aa  168  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  31.22 
 
 
1011 aa  165  5e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.16 
 
 
926 aa  161  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  27.23 
 
 
980 aa  161  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  26.8 
 
 
965 aa  160  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  29.25 
 
 
2711 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  26.11 
 
 
954 aa  158  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  26.34 
 
 
974 aa  150  1e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  26.45 
 
 
909 aa  148  4e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.82 
 
 
1446 aa  147  7e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  26.39 
 
 
942 aa  147  8e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  26.72 
 
 
970 aa  142  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  30.21 
 
 
488 aa  139  3e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  26.23 
 
 
970 aa  139  3e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  3.19801e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.06 
 
 
710 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  26.1 
 
 
998 aa  131  7e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  24.29 
 
 
1156 aa  131  7e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  28.91 
 
 
816 aa  130  1e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.37 
 
 
979 aa  129  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  23.87 
 
 
1154 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  25.71 
 
 
949 aa  125  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  4.85293e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.96 
 
 
1081 aa  123  2e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.35 
 
 
1532 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  28.67 
 
 
1180 aa  122  5e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.55 
 
 
1179 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  24.57 
 
 
1121 aa  120  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  24.2 
 
 
959 aa  119  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  26.05 
 
 
947 aa  117  9e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.27 
 
 
1134 aa  116  2e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.04 
 
 
1489 aa  112  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  28.78 
 
 
1175 aa  110  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.94 
 
 
1177 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  29.12 
 
 
1066 aa  101  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.07412e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.83 
 
 
577 aa  101  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.18 
 
 
479 aa  100  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  26.97 
 
 
407 aa  100  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  27.94 
 
 
1325 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  30.79 
 
 
911 aa  99  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.94 
 
 
1454 aa  98.6  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>