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for query gene PSPA7_1571 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  100 
 
 		 392 aa  760    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  99.23 
 
 		 392 aa  756    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  70.15 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  70.84 
 
 		 393 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  69.74 
 
 		 398 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  70.84 
 
 		 393 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  71.1 
 
 		 393 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  71.91 
 
 		 393 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  68.56 
 
 		 398 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.9 
 
 		 389 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  69.05 
 
 		 392 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  52.01 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  48.81 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.13 
 
 		 406 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.1 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  45.19 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.56 
 
 		 414 aa  292  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.45 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.3 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.24 
 
 		 412 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.19 
 
 		 394 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.74 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.96 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.5 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  37.76 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.06 
 
 		 403 aa  262  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.06 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.22 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.84 
 
 		 399 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.84 
 
 		 409 aa  252  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.89 
 
 		 399 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.32 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.88 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.43 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.49 
 
 		 392 aa  245  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.4 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.64 
 
 		 416 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.36 
 
 		 412 aa  242  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.6 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.67 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.08 
 
 		 408 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.53 
 
 		 409 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.09 
 
 		 412 aa  239  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  38.79 
 
 		 420 aa  239  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.06 
 
 		 419 aa  238  9e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.79 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  40.71 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.69 
 
 		 410 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  41.79 
 
 		 416 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.86 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  38.15 
 
 		 426 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.63 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.79 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.79 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  38.54 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.79 
 
 		 419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  41.54 
 
 		 416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  41.54 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  40.85 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.54 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.54 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.49 
 
 		 384 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  41.79 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.29 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.25 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3306  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.13 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.11 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3518  MFS permease  39.09 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.29 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.93 
 
 		 417 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.96 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.29 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.29 
 
 		 458 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.02 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.47 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.39 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  43.47 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.02 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.39 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  44.17 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.62 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.26 
 
 		 408 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  42.51 
 
 		 411 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.24 
 
 		 405 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.75 
 
 		 398 aa  222  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  37.69 
 
 		 400 aa  222  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.11 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.53 
 
 		 436 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.79 
 
 		 435 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.44 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.02 
 
 		 398 aa  219  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.61 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.57 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.75 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.53 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.05 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.05 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.69 
 
 		 401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.73 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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