52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1520 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1520  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  687    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17510  hypothetical protein  97.01 
 
 		 335 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.07 
 
 		 470 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.75 
 
 		 470 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.58 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  40.84 
 
 		 475 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.99 
 
 		 480 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43 
 
 		 487 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  43 
 
 		 487 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  41.57 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.19 
 
 		 472 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.19 
 
 		 472 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  30.06 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  30.25 
 
 		 169 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  28.08 
 
 		 432 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  24.76 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  27.89 
 
 		 450 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.89 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 450 aa  46.2  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  23.91 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  25.96 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3857  WD40 domain protein beta Propeller  27.35 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  26.82 
 
 		 1042 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1042 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.88 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.45 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.52 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  25.61 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  25.42 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  24.76 
 
 		 434 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.06 
 
 		 683 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  24.48 
 
 		 560 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.82 
 
 		 1040 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  24.28 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  24.28 
 
 		 437 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 441 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  25.42 
 
 		 430 aa  43.5  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 		 686 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.37 
 
 		 292 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 431 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.57 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  25.19 
 
 		 442 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  28.57 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  28.57 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 430 aa  42.7  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  28.95 
 
 		 439 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  27.21 
 
 		 442 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  27.97 
 
 		 426 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>