More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1498 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3565  amino acid carrier protein  81.08 
 
 		 481 aa  714    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0685949  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  68.21 
 
 		 477 aa  648    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  68.29 
 
 		 477 aa  663    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  100 
 
 		 471 aa  939    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  68.35 
 
 		 494 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  98.94 
 
 		 471 aa  932    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  67.51 
 
 		 476 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  63.64 
 
 		 474 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  60.68 
 
 		 480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  61.36 
 
 		 488 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  58.89 
 
 		 489 aa  568  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  61.11 
 
 		 493 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  62.18 
 
 		 480 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  61.36 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3144  amino acid carrier protein  61.15 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0262714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  61.11 
 
 		 481 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  60.98 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  61.97 
 
 		 480 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3242  amino acid carrier protein  62.18 
 
 		 480 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  57.78 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  60.26 
 
 		 483 aa  541  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2730  amino acid carrier protein  59.91 
 
 		 504 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000165436  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  58.89 
 
 		 480 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1047  amino acid carrier protein  61.75 
 
 		 480 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  57.51 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  58.37 
 
 		 492 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  53.89 
 
 		 485 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  56.03 
 
 		 468 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  53.47 
 
 		 476 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0006  amino-acid carrier protein AlsT  53.68 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  53.68 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  55.36 
 
 		 498 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0006  amino-acid carrier protein AlsT  53.68 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0332289  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  54.87 
 
 		 502 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  56.53 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  56.53 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2575  amino acid carrier protein  53.19 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  55.67 
 
 		 471 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  53.18 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0569  amino acid carrier protein  54.39 
 
 		 476 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.352189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0422  amino acid carrier family protein  53.62 
 
 		 477 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.797168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02218  putative amino acid permease  53.32 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00221678  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0483  amino acid carrier family protein  53.19 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489215  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1842  amino acid carrier protein  51.39 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  50.22 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  50.76 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  49.37 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  49.05 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  50.99 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  51.21 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  49.16 
 
 		 476 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  51.21 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  50.33 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  52.03 
 
 		 466 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  51.61 
 
 		 466 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  50.33 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  51.95 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  50.99 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3589  amino acid carrier protein  51.82 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  49.05 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  49.05 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  51.32 
 
 		 470 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00007  predicted transporter  51.39 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0007  amino acid carrier protein  51.82 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.665719  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0008  amino acid carrier protein  51.61 
 
 		 476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.876133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0006  amino acid carrier protein  51.82 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  51.26 
 
 		 503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00007  hypothetical protein  51.39 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  51.26 
 
 		 503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3648  amino acid carrier protein  51.39 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  47.93 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0007  amino acid carrier protein  51.39 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  47.2 
 
 		 483 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  51.26 
 
 		 503 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  51.26 
 
 		 503 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  47.2 
 
 		 483 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  50.94 
 
 		 497 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  51.26 
 
 		 503 aa  445  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  47.82 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  51.26 
 
 		 503 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  47.4 
 
 		 479 aa  441  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  51.26 
 
 		 503 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0008  amino acid carrier protein  51.39 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.248678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  51.05 
 
 		 503 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  47.4 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  47.1 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  47.4 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  47.39 
 
 		 479 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  50.84 
 
 		 495 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  47.1 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  47.38 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  50.73 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  47.4 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  50.94 
 
 		 504 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  50.73 
 
 		 497 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  50.94 
 
 		 504 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  50.73 
 
 		 497 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  47.18 
 
 		 479 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  51.8 
 
 		 493 aa  435  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  48.84 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>