More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1484 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  100 
 
 
289 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  100 
 
 
289 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  89.62 
 
 
289 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  78.89 
 
 
287 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  78.55 
 
 
287 aa  438  1e-122  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  80.28 
 
 
287 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  77.85 
 
 
287 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  78.89 
 
 
287 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  78.55 
 
 
287 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  78.2 
 
 
287 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  78.89 
 
 
287 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  58.51 
 
 
285 aa  307  1e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  57.09 
 
 
283 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  57.09 
 
 
283 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  57.09 
 
 
283 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  57.09 
 
 
283 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  57.09 
 
 
283 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  57.09 
 
 
283 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  57.09 
 
 
283 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  57.09 
 
 
283 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  57.09 
 
 
283 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  57.09 
 
 
285 aa  299  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  56.38 
 
 
283 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  56.38 
 
 
283 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  56.38 
 
 
283 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  56.38 
 
 
283 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  55.32 
 
 
283 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  56.03 
 
 
283 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  56.38 
 
 
283 aa  295  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  56.38 
 
 
283 aa  295  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  55.59 
 
 
286 aa  291  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.05 
 
 
289 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  55.32 
 
 
285 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.40304e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  55.32 
 
 
285 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  55.32 
 
 
285 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  4.83484e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  54.96 
 
 
283 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  54.3 
 
 
292 aa  288  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  51.69 
 
 
292 aa  285  6e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  51.69 
 
 
292 aa  285  8e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  56.32 
 
 
290 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  58.63 
 
 
306 aa  281  7e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  52.19 
 
 
293 aa  279  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  51.74 
 
 
289 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  52.6 
 
 
293 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  52.4 
 
 
290 aa  273  2e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  51.33 
 
 
302 aa  271  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  51.89 
 
 
294 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  52.69 
 
 
290 aa  267  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  53.02 
 
 
283 aa  265  7e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  50.35 
 
 
292 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  50.34 
 
 
296 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  51.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  50.34 
 
 
296 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  47.57 
 
 
291 aa  258  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  49.48 
 
 
292 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  49.48 
 
 
292 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  48.76 
 
 
292 aa  254  1e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  52.28 
 
 
282 aa  254  1e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  48.79 
 
 
294 aa  245  7e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  49.83 
 
 
292 aa  245  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  48.44 
 
 
292 aa  244  9e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  47.75 
 
 
292 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  52.45 
 
 
283 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.33846e-07  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  48.79 
 
 
294 aa  240  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03236  elongation factor Ts  53.19 
 
 
281 aa  234  1e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2426  elongation factor Ts  53.33 
 
 
282 aa  233  2e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00181853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  47.54 
 
 
291 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.39027e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  48.83 
 
 
294 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.57358e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1850  elongation factor Ts  51.61 
 
 
280 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.27669e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  43.58 
 
 
294 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.72472e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  44.44 
 
 
291 aa  222  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0528  translation elongation factor Ts  40.36 
 
 
280 aa  222  7e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  47.49 
 
 
294 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  47.68 
 
 
293 aa  221  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  47.68 
 
 
293 aa  221  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  44.52 
 
 
290 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2634  elongation factor Ts  52.96 
 
 
282 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.54469e-07  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2884  elongation factor Ts  52 
 
 
303 aa  219  4e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.3426e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  45.83 
 
 
291 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  47.22 
 
 
291 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  45.33 
 
 
294 aa  218  7e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.49192e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  48.15 
 
 
292 aa  218  9e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  47.46 
 
 
292 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3280  elongation factor Ts  52.61 
 
 
282 aa  216  3e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141167  hitchhiker  7.39911e-05 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.75 
 
 
291 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002747  translation elongation factor Ts  51.58 
 
 
281 aa  215  6e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  9.73884e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  44.34 
 
 
310 aa  214  1e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.00093e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  44.44 
 
 
296 aa  212  5e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  42.91 
 
 
291 aa  212  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.46628e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1630  elongation factor Ts  50.35 
 
 
283 aa  211  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  46.33 
 
 
291 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2814  elongation factor Ts  50 
 
 
283 aa  209  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81155e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2707  elongation factor Ts  50 
 
 
283 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.89418e-06  normal  0.0108139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2640  elongation factor Ts  50 
 
 
283 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.4092e-07  normal  0.161673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1349  elongation factor Ts  50 
 
 
283 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.81434e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  43.17 
 
 
313 aa  208  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.33 
 
 
303 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  44.22 
 
 
292 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  45.3 
 
 
293 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  45.3 
 
 
293 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>