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for query gene PSPA7_1461 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 212 aa  410  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  63 
 
 		 211 aa  261  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  65.5 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  62.19 
 
 		 209 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  62.19 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 213 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  46.53 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  42.33 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  36.32 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  34.54 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  34 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.16 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 188 aa  95.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  33.83 
 
 		 234 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 230 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  31.61 
 
 		 250 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  37.11 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.16 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 219 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 247 aa  88.6  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 247 aa  88.6  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  30.85 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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