129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1419 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  100 
 
 
497 aa  1035    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.99 
 
 
481 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.84 
 
 
481 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.84 
 
 
481 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.39 
 
 
491 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.21 
 
 
491 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.74 
 
 
481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.81 
 
 
491 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.07 
 
 
473 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.59 
 
 
477 aa  361  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.88 
 
 
481 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.2 
 
 
487 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  40 
 
 
491 aa  323  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.92 
 
 
471 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.08 
 
 
485 aa  312  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  39.79 
 
 
487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.39 
 
 
486 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  47.72 
 
 
216 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  44.75 
 
 
221 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  44.29 
 
 
221 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  44.29 
 
 
221 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  44.29 
 
 
221 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  43.84 
 
 
221 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  43.84 
 
 
221 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  43.84 
 
 
221 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  41.63 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  43.84 
 
 
221 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  43.84 
 
 
221 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  43.84 
 
 
221 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  40.77 
 
 
456 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  43.5 
 
 
455 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
197 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  44.39 
 
 
458 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  43.17 
 
 
455 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  41.26 
 
 
455 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  42.73 
 
 
455 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  42.73 
 
 
455 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  41.85 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  41.26 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  40.36 
 
 
455 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  40.36 
 
 
455 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  40.97 
 
 
455 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  41.35 
 
 
459 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  40.97 
 
 
455 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  43.78 
 
 
458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  38.79 
 
 
197 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  36.96 
 
 
220 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  35.91 
 
 
445 aa  133  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  38 
 
 
201 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  36.95 
 
 
201 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  32.66 
 
 
236 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  28.21 
 
 
389 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  28.72 
 
 
390 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  27.58 
 
 
388 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  27.16 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  33.66 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  24.62 
 
 
534 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  24.62 
 
 
534 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  24.62 
 
 
534 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  31.28 
 
 
211 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  31.28 
 
 
356 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  27.24 
 
 
378 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  31.68 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  32.19 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  29.11 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  27.71 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  26.36 
 
 
651 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  31.6 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  27.44 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  31.6 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  31.6 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  31.6 
 
 
214 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  31.6 
 
 
214 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  31.6 
 
 
214 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  31.6 
 
 
214 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  31.93 
 
 
729 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  31.93 
 
 
729 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  28.28 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  28.28 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  28.28 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  28.28 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  28.28 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  28.28 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  28.28 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  26.32 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  35.66 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  26 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  31.22 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  25.79 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  29.72 
 
 
244 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  29.25 
 
 
172 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  27.5 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  27.85 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 
727 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  27.92 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  27.92 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  27.14 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  29.41 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  29.63 
 
 
251 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>