241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1384 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  89.34 
 
 
469 aa  872    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  89.13 
 
 
469 aa  870    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  91.9 
 
 
469 aa  880    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  89.13 
 
 
469 aa  870    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  87.42 
 
 
469 aa  865    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  87.63 
 
 
469 aa  865    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  88.49 
 
 
469 aa  871    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  66.45 
 
 
465 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  89.55 
 
 
469 aa  872    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  100 
 
 
469 aa  968    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  98.72 
 
 
469 aa  959    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  89.98 
 
 
469 aa  877    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  66.09 
 
 
461 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  72.57 
 
 
466 aa  706    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  63.64 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  58.44 
 
 
467 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  56.83 
 
 
463 aa  537  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  57.24 
 
 
466 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  56.01 
 
 
461 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  55.84 
 
 
468 aa  519  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  56.06 
 
 
463 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  55.15 
 
 
461 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  55.63 
 
 
463 aa  521  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  56.06 
 
 
463 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  55.15 
 
 
461 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  54.21 
 
 
470 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  54.08 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  54.13 
 
 
470 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  55.46 
 
 
473 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  52.27 
 
 
470 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  53.26 
 
 
462 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  53.03 
 
 
470 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  55.26 
 
 
465 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  53.68 
 
 
465 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  52.68 
 
 
471 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  54.25 
 
 
462 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  52.05 
 
 
470 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  51.62 
 
 
470 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  52.26 
 
 
474 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  52.92 
 
 
465 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  54.11 
 
 
471 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  53.03 
 
 
471 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  51.41 
 
 
473 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  51.97 
 
 
471 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  49.25 
 
 
471 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  54.86 
 
 
459 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  50.54 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  49.46 
 
 
460 aa  465  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  50.64 
 
 
472 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  50.44 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  49.89 
 
 
472 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  50.55 
 
 
472 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  53.86 
 
 
467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  50 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  49.78 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  51.61 
 
 
435 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  46.98 
 
 
460 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  49.67 
 
 
458 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  47.84 
 
 
461 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  49.35 
 
 
458 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  46.77 
 
 
461 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  49.68 
 
 
461 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  47.93 
 
 
460 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  46.04 
 
 
463 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0662  threonine synthase  42.98 
 
 
462 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0696  threonine synthase  42.98 
 
 
462 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  44.75 
 
 
504 aa  386  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  44.44 
 
 
476 aa  378  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  41.63 
 
 
511 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  42.68 
 
 
475 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  42.68 
 
 
475 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  43.61 
 
 
476 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  43.61 
 
 
476 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  44.33 
 
 
453 aa  364  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  44.12 
 
 
475 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  43.19 
 
 
473 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  42.98 
 
 
473 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  44.33 
 
 
480 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  42.35 
 
 
476 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  43.76 
 
 
471 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  43.19 
 
 
481 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  42.35 
 
 
475 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  43.12 
 
 
516 aa  352  7e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  42.25 
 
 
470 aa  352  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  41.09 
 
 
517 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  42.86 
 
 
475 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  41.74 
 
 
472 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  41.17 
 
 
547 aa  351  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  42.18 
 
 
482 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  40.62 
 
 
480 aa  349  6e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  44.88 
 
 
487 aa  348  9e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  40.29 
 
 
480 aa  348  9e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  42.62 
 
 
483 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  42.92 
 
 
477 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  42.42 
 
 
483 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  42.41 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  42.3 
 
 
483 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  40.66 
 
 
483 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  41.77 
 
 
481 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  41.98 
 
 
481 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.974615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>