More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1378 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  290  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  290  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  91.97 
 
 
137 aa  258  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  85.07 
 
 
135 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  84.33 
 
 
135 aa  239  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  84.96 
 
 
135 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  84.33 
 
 
135 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  76.26 
 
 
143 aa  228  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  69.35 
 
 
129 aa  185  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  65.65 
 
 
149 aa  183  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  65.87 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  63.57 
 
 
141 aa  181  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 
142 aa  180  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  65.08 
 
 
154 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  65.08 
 
 
154 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  65.08 
 
 
154 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  65.08 
 
 
154 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  68.03 
 
 
131 aa  177  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  63.78 
 
 
145 aa  177  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  65.32 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  65.32 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  65.32 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  65.32 
 
 
143 aa  176  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  64.29 
 
 
143 aa  176  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  65.57 
 
 
131 aa  174  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  60.77 
 
 
141 aa  173  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  60.16 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  59.2 
 
 
136 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  62.3 
 
 
127 aa  165  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  63.56 
 
 
131 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  60.83 
 
 
132 aa  156  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 
132 aa  154  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  50.43 
 
 
120 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  50.43 
 
 
120 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
131 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  49.11 
 
 
136 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
133 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 
141 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 
143 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 
165 aa  103  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 
263 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  42.24 
 
 
260 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  38.4 
 
 
176 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  38.4 
 
 
176 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 
265 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
176 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.39 
 
 
176 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  37.69 
 
 
164 aa  88.6  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.94 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.94 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  40.94 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  40.94 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.94 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.94 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.16 
 
 
168 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.16 
 
 
168 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.16 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
178 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  39.34 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  40.68 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 
167 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  34.65 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.94 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  33.03 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  33.03 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
175 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.78 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  34.21 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  34.21 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>