99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1294 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  360  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  97.25 
 
 
182 aa  329  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  84.18 
 
 
180 aa  278  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  82.12 
 
 
182 aa  277  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  77.65 
 
 
179 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  77.97 
 
 
180 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  79.65 
 
 
177 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  78.61 
 
 
176 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  78.03 
 
 
176 aa  256  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  75.98 
 
 
179 aa  253  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  57.95 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  57.95 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  57.95 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  57.95 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  57.39 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  57.39 
 
 
179 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  56.82 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  56.82 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  56.82 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  56.82 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  56.82 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  56.82 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  56.82 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  56.82 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  59.48 
 
 
175 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  54.24 
 
 
178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  59.32 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  59.32 
 
 
179 aa  194  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  58.52 
 
 
179 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  58.52 
 
 
179 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  57.95 
 
 
179 aa  191  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  50.85 
 
 
179 aa  184  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  58.29 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  53.67 
 
 
179 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  52.38 
 
 
181 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06571  hypothetical protein  46.94 
 
 
172 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000695  hypothetical protein  46.26 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.86494  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  39.04 
 
 
257 aa  97.8  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  39.04 
 
 
257 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  44.06 
 
 
263 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1170  17 kDa surface antigen  55.42 
 
 
120 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  30.06 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  33.92 
 
 
206 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  34.33 
 
 
376 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  39.58 
 
 
208 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  45.07 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  45.07 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  34.66 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2643  17 kDa surface antigen  35.8 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.796605  normal  0.311018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  29.21 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000036604  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  58.7 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  56.52 
 
 
272 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  58.7 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  58.7 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  58.7 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  58.7 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  58.7 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  58.7 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  58.7 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  58.7 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  36.94 
 
 
165 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  34.62 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  56.52 
 
 
216 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  61.9 
 
 
218 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  34.38 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  31.97 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  40.23 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  31.15 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04299  17 kDa surface antigen family protein  33.33 
 
 
126 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  45.28 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1858  17 kDa surface antigen  26.32 
 
 
223 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.699281  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0378  17 kDa surface antigen  32.12 
 
 
217 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  32.12 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  40.35 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  30.77 
 
 
158 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  57.14 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2741  17 kDa surface antigen  31.06 
 
 
226 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.29195  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2231  17 kDa surface antigen  31.06 
 
 
226 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.302899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  32.43 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0312  hypothetical protein  23.36 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0282  hypothetical protein  23.36 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  37.31 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  42.11 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  32.8 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  57.14 
 
 
269 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  42.11 
 
 
147 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  41.11 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  35.83 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3476  17 kDa surface antigen  62.5 
 
 
84 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1570  17 kDa surface antigen  31.15 
 
 
163 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000417711  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  48.72 
 
 
259 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  65.52 
 
 
294 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01571  hypothetical protein  32 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  48.65 
 
 
155 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  65.52 
 
 
280 aa  40.8  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>