More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1275 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
264 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  99.24 
 
 
264 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  86.74 
 
 
264 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  86.74 
 
 
264 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  86.74 
 
 
264 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  86.36 
 
 
264 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  81.06 
 
 
264 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  79.55 
 
 
264 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  80.3 
 
 
264 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  79.92 
 
 
264 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  80.3 
 
 
264 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  80.68 
 
 
264 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  80.3 
 
 
264 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  80.3 
 
 
264 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  80.3 
 
 
264 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  80.3 
 
 
264 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  80.3 
 
 
264 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  79.92 
 
 
264 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  80.3 
 
 
264 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  79.17 
 
 
264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  79.17 
 
 
264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  79.17 
 
 
264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  75.76 
 
 
264 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  75.76 
 
 
264 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  75.76 
 
 
264 aa  394  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  75.67 
 
 
264 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  70.34 
 
 
264 aa  367  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  68.56 
 
 
264 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  69.58 
 
 
264 aa  365  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  70.34 
 
 
264 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  65.4 
 
 
264 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  63.64 
 
 
264 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  63.64 
 
 
264 aa  331  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  67.8 
 
 
264 aa  330  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  61.36 
 
 
264 aa  325  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  57.89 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  63.27 
 
 
245 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  58.94 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  59.25 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 
264 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 
264 aa  301  7.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  55.89 
 
 
264 aa  287  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  51.7 
 
 
267 aa  278  7e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  50.95 
 
 
267 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  53.03 
 
 
264 aa  274  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  52.47 
 
 
264 aa  274  9e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  54.55 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  54.2 
 
 
263 aa  269  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 
267 aa  267  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  51.15 
 
 
262 aa  264  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  50.19 
 
 
264 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  51.14 
 
 
264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  51.33 
 
 
265 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  49.43 
 
 
265 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  49.05 
 
 
264 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  52.29 
 
 
263 aa  251  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  50.8 
 
 
260 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  50 
 
 
270 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  47.91 
 
 
264 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
270 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  42.59 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  48.67 
 
 
296 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
265 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  48.39 
 
 
282 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  41.34 
 
 
257 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  38.55 
 
 
261 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  43.2 
 
 
254 aa  205  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
252 aa  202  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.06 
 
 
256 aa  201  9e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  40.55 
 
 
251 aa  199  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.6 
 
 
254 aa  192  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.54 
 
 
251 aa  189  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 
253 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  37.39 
 
 
242 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  35.74 
 
 
252 aa  118  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  32.67 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.57 
 
 
285 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  35.68 
 
 
241 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  33.05 
 
 
257 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  30.87 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  38.89 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  32.93 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  30.58 
 
 
290 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  33.33 
 
 
242 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 
245 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  32.76 
 
 
271 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.04 
 
 
281 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  33.92 
 
 
240 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  32.64 
 
 
276 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  33.2 
 
 
329 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.15 
 
 
261 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  32.66 
 
 
289 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  35.19 
 
 
271 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  38.03 
 
 
245 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  32.41 
 
 
242 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  37.85 
 
 
245 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 
246 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>