More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1115 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  90.71 
 
 		 448 aa  816    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  100 
 
 		 448 aa  906    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  62.8 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  68.72 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  62.76 
 
 		 438 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  62.09 
 
 		 445 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  60.84 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  65.3 
 
 		 438 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  65.55 
 
 		 438 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  65.3 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  57.04 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  60.85 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  51.73 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  52.01 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  54.01 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  53.6 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  50.24 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  46.39 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  53.62 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  53.08 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  52.26 
 
 		 409 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  51.18 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  52.59 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  50.38 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  49.63 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  51.34 
 
 		 419 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  49.75 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  49.19 
 
 		 417 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  48.92 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  50.13 
 
 		 454 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  49.21 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  48.94 
 
 		 398 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  48.63 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  48.92 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  47.24 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  46.11 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  47.7 
 
 		 413 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  48.03 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  48.29 
 
 		 720 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  46.55 
 
 		 429 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 		 398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  48.93 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  46.5 
 
 		 398 aa  328  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  46.76 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  47.16 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  44.15 
 
 		 409 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  47.75 
 
 		 462 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  48.85 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  47.48 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  49.19 
 
 		 392 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  45.38 
 
 		 412 aa  323  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  47.04 
 
 		 514 aa  319  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  44.09 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  44.83 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  47.88 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 464 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  47.75 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  51.88 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  44.87 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  43.85 
 
 		 412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  46.07 
 
 		 430 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  44.66 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  45.41 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  44.79 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  42.3 
 
 		 464 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  45.33 
 
 		 398 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  45.07 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  44.16 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  44.59 
 
 		 400 aa  305  7e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  41.86 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  44.94 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 		 393 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  44.41 
 
 		 405 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 		 393 aa  302  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  44.59 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  42.64 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  46.36 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  45.24 
 
 		 405 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  43.59 
 
 		 395 aa  299  7e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.3 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.09 
 
 		 418 aa  295  8e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  47.31 
 
 		 486 aa  295  8e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  43.86 
 
 		 405 aa  295  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  40.62 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  43.28 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  43.29 
 
 		 491 aa  293  6e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  41.07 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  41.44 
 
 		 417 aa  289  6e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  41.37 
 
 		 474 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  42.97 
 
 		 407 aa  286  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  43.39 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  43.41 
 
 		 445 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.79 
 
 		 421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  41.58 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  39.89 
 
 		 395 aa  280  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  40.16 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  42.54 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  39.69 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  41.65 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>