229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1035 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  99.57 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  64.66 
 
 		 228 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  65.05 
 
 		 228 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  70.73 
 
 		 227 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  70.44 
 
 		 227 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  71.43 
 
 		 227 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  69.95 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  48.48 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  48.5 
 
 		 224 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  47.89 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  44.2 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  53.74 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  45.81 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  43.29 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  42.67 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  44.96 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  43.53 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  43.1 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  43.1 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  45.45 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  42.24 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  44.49 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  47.6 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  47.12 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  42.73 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  42.55 
 
 		 210 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  46.98 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  43.64 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  40.52 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  42.74 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  43.23 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  44.26 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  44.26 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  44.26 
 
 		 212 aa  178  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  43.83 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  43.83 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  43.83 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  43.83 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  43.1 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  43.83 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  43.09 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  40.95 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  40.52 
 
 		 213 aa  175  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  40.52 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  40.09 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  40.6 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  40.6 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  41.41 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  44.26 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  44.26 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  40.17 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  44.26 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  40.17 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  40.17 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  40.17 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  43.83 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  43.83 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  39.21 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  43.59 
 
 		 209 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  39.66 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  40 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  38.79 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  36.99 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  37.67 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1244  OmpW  35.71 
 
 		 195 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000847221  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  40.44 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  40.44 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  36.12 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  35.78 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  36.41 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  34.74 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  34.38 
 
 		 200 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  36.36 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  39.41 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  34.76 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  33.96 
 
 		 211 aa  98.6  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  32.03 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  31.6 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  31.86 
 
 		 211 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  32.98 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  28.1 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  32.12 
 
 		 267 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  31.47 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  30.57 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  29.47 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  26.56 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  27.39 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  34.94 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  31.19 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  35.71 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  28.57 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  28.57 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  29.28 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  27.93 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  25.7 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  28.33 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  33.95 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  33.33 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  30.29 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>