More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0984 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  100 
 
 		 397 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  87.15 
 
 		 397 aa  710    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  60.82 
 
 		 388 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  59.35 
 
 		 378 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  57.94 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  52.56 
 
 		 390 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  55.24 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  54.97 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  55.59 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  47.59 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  56.82 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  47.09 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  47.09 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  46.58 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  47.14 
 
 		 394 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  47 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  48.32 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  48.34 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  48.04 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  48.67 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  47.11 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  49.86 
 
 		 383 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  45.22 
 
 		 401 aa  358  8e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  46.7 
 
 		 391 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  47.47 
 
 		 378 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  49.01 
 
 		 384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  52.66 
 
 		 380 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  44.59 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  52.66 
 
 		 380 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  52.38 
 
 		 380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  50.97 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  43.98 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  43.98 
 
 		 377 aa  329  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  43.72 
 
 		 377 aa  328  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  43.19 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  43.72 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  43.92 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  42.93 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  42.59 
 
 		 409 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  42.59 
 
 		 409 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  42.93 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  42.93 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  46.91 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  42.93 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  42.82 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  46.91 
 
 		 389 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  45.94 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  46.91 
 
 		 389 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  45.66 
 
 		 389 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  44.56 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  45.66 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  46.38 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  42.11 
 
 		 401 aa  292  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  44.15 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  46.43 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  38.98 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  36.68 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  27.03 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.08 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  28.12 
 
 		 494 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  28.89 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  27.91 
 
 		 498 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  23.82 
 
 		 544 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  24.62 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.6 
 
 		 505 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25.2 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.36 
 
 		 404 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.24 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.38 
 
 		 601 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.67 
 
 		 635 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  35 
 
 		 717 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  24.59 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  26.45 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  27.47 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  25 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  24.63 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.51 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  22.98 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  21.79 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.98 
 
 		 595 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.57 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.48 
 
 		 650 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  25.74 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  31.86 
 
 		 658 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  23.17 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  23.69 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  23.47 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.93 
 
 		 1032 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  23.7 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  28.94 
 
 		 638 aa  76.3  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  22.92 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  26.38 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  27.7 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.13 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.44 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  21.32 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  23.45 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  34.13 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  23.47 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  26.5 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>