17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0983 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0983  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  257  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10780  hypothetical protein  92.42 
 
 
132 aa  241  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.10579  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27070  hypothetical protein  72.66 
 
 
129 aa  176  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.700813  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1960  hypothetical protein  65.41 
 
 
133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228739  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3810  hypothetical protein  63.91 
 
 
133 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500224  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3105  hypothetical protein  68.8 
 
 
137 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264857  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2082  hypothetical protein  63.91 
 
 
133 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2098  hypothetical protein  65.15 
 
 
138 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387663  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2217  hypothetical protein  64.29 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2445  hypothetical protein  60.9 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2107  hypothetical protein  65 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1998  hypothetical protein  63.2 
 
 
134 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0532492  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1705  hypothetical protein  60.61 
 
 
135 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.934345 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1851  hypothetical protein  60.16 
 
 
158 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3158  hypothetical protein  57.6 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00000000241289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4020  hypothetical protein  56.92 
 
 
131 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.924607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1190  hypothetical protein  53.85 
 
 
151 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.311704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>