43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0949 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0949  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1213    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0762  FAD binding domain-containing protein  56.01 
 
 
586 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.30819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0751  FAD binding domain-containing protein  56.19 
 
 
586 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10370  hypothetical protein  91.62 
 
 
597 aa  1103    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6465  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.3 
 
 
582 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0929  cholesterol oxidase  56.19 
 
 
586 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0619  cholesterol oxidase  56.01 
 
 
645 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0725  hypothetical protein  53.47 
 
 
584 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  25.64 
 
 
437 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  27.75 
 
 
437 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
437 aa  60.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  24.71 
 
 
437 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  22.85 
 
 
452 aa  60.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  24.71 
 
 
437 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
437 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  24.71 
 
 
437 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  27.17 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  28.32 
 
 
437 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  28.17 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  28.32 
 
 
438 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  24.02 
 
 
439 aa  58.9  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  29.09 
 
 
434 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  28.41 
 
 
473 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  25.73 
 
 
437 aa  55.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  23.27 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  26.71 
 
 
441 aa  51.6  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  26.12 
 
 
469 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  28.76 
 
 
425 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  30.53 
 
 
411 aa  48.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  22.66 
 
 
434 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  23.46 
 
 
445 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  30.41 
 
 
558 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  29.73 
 
 
457 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  28.25 
 
 
442 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  28.66 
 
 
1055 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  26.71 
 
 
423 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 
462 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  28.4 
 
 
431 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  26.72 
 
 
415 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 
470 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  27.89 
 
 
457 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 
1023 aa  43.9  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.33 
 
 
463 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>