245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0898 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  97.57 
 
 
288 aa  567  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  76.22 
 
 
288 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  76.09 
 
 
288 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  62.59 
 
 
287 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  62.14 
 
 
295 aa  337  9e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  40.73 
 
 
285 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  36.86 
 
 
287 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 
285 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 
282 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  43.08 
 
 
284 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  41.33 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  36.29 
 
 
280 aa  161  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  35.61 
 
 
279 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  40.31 
 
 
278 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  35.56 
 
 
287 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  39.54 
 
 
284 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  36.67 
 
 
280 aa  143  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 
280 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  37.83 
 
 
284 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  37.45 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  30.98 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 
281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 
282 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 
280 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 
280 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  33.71 
 
 
282 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 
302 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  30.82 
 
 
284 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  30.93 
 
 
284 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 
284 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  30.14 
 
 
284 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 
284 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
284 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  36.8 
 
 
283 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 
284 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  25.67 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  28.63 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.48 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  27.63 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  25.88 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.7 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  28.78 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  30.2 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  29.17 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  29.47 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  30.33 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  26.91 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
332 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  32.04 
 
 
229 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
295 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 
330 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  27.69 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  27.36 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 
262 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  40.54 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  26.56 
 
 
238 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  26.67 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 
321 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
299 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 
306 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
326 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  24.64 
 
 
327 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  27.69 
 
 
342 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
324 aa  58.9  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>