More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0869 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  100 
 
 
476 aa  944    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  87.39 
 
 
476 aa  833    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.67 
 
 
481 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.04 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.33 
 
 
476 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.33 
 
 
476 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.15 
 
 
484 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  48.94 
 
 
492 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.15 
 
 
484 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  50.99 
 
 
481 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  37.72 
 
 
467 aa  286  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  40.39 
 
 
469 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.24 
 
 
460 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  41.46 
 
 
482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  41.01 
 
 
461 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  36.66 
 
 
485 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.33 
 
 
464 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  39.45 
 
 
455 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  38.55 
 
 
483 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.33 
 
 
464 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.33 
 
 
464 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.33 
 
 
464 aa  229  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.11 
 
 
464 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.33 
 
 
464 aa  229  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.11 
 
 
464 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  39.18 
 
 
486 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.11 
 
 
464 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.11 
 
 
464 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  39.9 
 
 
445 aa  226  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.59 
 
 
464 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  32.96 
 
 
464 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  37.56 
 
 
451 aa  216  8e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  36.18 
 
 
451 aa  213  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  35.31 
 
 
452 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  36.51 
 
 
495 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  39.37 
 
 
554 aa  199  7e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  29.18 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  29.18 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  33.85 
 
 
506 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  35.43 
 
 
412 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.95 
 
 
471 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  35.11 
 
 
415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  35.39 
 
 
452 aa  190  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  31.56 
 
 
456 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  36.62 
 
 
466 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  35.68 
 
 
449 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  36.44 
 
 
467 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.74 
 
 
471 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  41.92 
 
 
409 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  36.9 
 
 
460 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  35.49 
 
 
414 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  41.22 
 
 
473 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  32.62 
 
 
498 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  31.55 
 
 
452 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  33.8 
 
 
452 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  28.26 
 
 
492 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  38.72 
 
 
492 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  40.73 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  37.5 
 
 
384 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  34.27 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  31.89 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  34.92 
 
 
452 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  34.36 
 
 
452 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  34.92 
 
 
452 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  35.88 
 
 
452 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  34.64 
 
 
452 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  34.92 
 
 
452 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  33.57 
 
 
407 aa  170  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.43 
 
 
452 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  33.25 
 
 
413 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.33 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  32.43 
 
 
418 aa  166  8e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  33.9 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  33.9 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  39.54 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  33.82 
 
 
447 aa  163  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  37.5 
 
 
386 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  38.19 
 
 
487 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  42.53 
 
 
424 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  37.09 
 
 
490 aa  159  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  35.32 
 
 
465 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  28.91 
 
 
477 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  40.3 
 
 
465 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  31.6 
 
 
473 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  35.42 
 
 
398 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  33.11 
 
 
475 aa  157  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  36.62 
 
 
462 aa  156  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  31.4 
 
 
514 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.78 
 
 
435 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  35.08 
 
 
406 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  27.74 
 
 
471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2439  isochorismate synthase  32.58 
 
 
468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.11 
 
 
379 aa  153  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  33.62 
 
 
402 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  37.7 
 
 
395 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  41.25 
 
 
259 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  35.82 
 
 
403 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  31.04 
 
 
517 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  29.02 
 
 
391 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  36.67 
 
 
435 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>