15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0743 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0743  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00643704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07810  hypothetical protein  89.23 
 
 		 353 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4006  hypothetical protein  48.07 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5128  hypothetical protein  46.39 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.933275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0439  hypothetical protein  44.06 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0408  hypothetical protein  45.27 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4794  hypothetical protein  44.59 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0442  hypothetical protein  44.78 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.468578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4620  hypothetical protein  44.3 
 
 		 334 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  0.677055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0558  hypothetical protein  43.14 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0745  hypothetical protein  36.76 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1056  hypothetical protein  26.96 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000661942  normal  0.66241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  24.17 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  32.67 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2669  hypothetical protein  31.45 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>