More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0665 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  100 
 
 		 231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  98.2 
 
 		 224 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.34 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.87 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  52.56 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  52.49 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  50.93 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  52.34 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  51.12 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  51.4 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02024  hydrolase  53.5 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247086  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  50.47 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  50.47 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  50.47 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  49.3 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  49.53 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  49.53 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  49.53 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  49.53 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  49.53 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  49.53 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  49.53 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  48.91 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  47.71 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  47.89 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  47.89 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  47.89 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  47.89 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  47.73 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  47.73 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  47.27 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  42.13 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.53 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  43.75 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  44.2 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  44.2 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  44.2 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5923  HAD family hydrolase  44.59 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  43.26 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2508  HAD family hydrolase  42.86 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.076946  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0705  HAD family hydrolase  45.21 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531272  normal  0.478044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  40.74 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2141  hypothetical protein  43.38 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00191152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.5 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.65 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  37.5 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  37.5 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  38.71 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5664  HAD family hydrolase  44.7 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3728  HAD family hydrolase  44.24 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4640  HAD family hydrolase  44.24 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  39.82 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  41.31 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.3 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  38.77 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.57 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  39.81 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  35.59 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0493  HAD family hydrolase  41.12 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0405108  hitchhiker  0.00191213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  36.11 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  38.81 
 
 		 227 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  39.44 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  36.24 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.52 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  39.72 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.63 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  32.23 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  38.81 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.57 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  39.57 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  38.36 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  33.92 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  40.96 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  37.67 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  39.04 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.77 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  40.84 
 
 		 228 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.39 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  35.89 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  35.26 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4727  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  33.69 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  40.21 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.34 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.68 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.96 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  33.33 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3773  HAD family hydrolase  41.36 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.86 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  37.17 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  36.41 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  34.04 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  37.1 
 
 		 224 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>