191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0646 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  95.96 
 
 
322 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  42.81 
 
 
314 aa  248  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  40.14 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  35.13 
 
 
302 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  32.42 
 
 
325 aa  165  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.55 
 
 
298 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  37.83 
 
 
269 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  34.84 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  38.49 
 
 
282 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.97 
 
 
363 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  35.97 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  35.02 
 
 
280 aa  132  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  37.23 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.33 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.43 
 
 
357 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.38 
 
 
353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  37.22 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32.5 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.08 
 
 
326 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  27.49 
 
 
316 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  37.56 
 
 
244 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.66 
 
 
323 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.33 
 
 
322 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  31.8 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  32.05 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.67 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  41.51 
 
 
405 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.33 
 
 
286 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.9 
 
 
464 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  30.14 
 
 
795 aa  92.8  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  32.72 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  36.9 
 
 
305 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  37.06 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  27.32 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  25.33 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  38.1 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.52 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  35.23 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  27.81 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.69 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  32.7 
 
 
471 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  31.9 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  29.14 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  32.89 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  29.28 
 
 
432 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  27.12 
 
 
486 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.72 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  29.5 
 
 
423 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  27.12 
 
 
372 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  35.56 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  26.25 
 
 
656 aa  64.3  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  26.74 
 
 
442 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  28.97 
 
 
450 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  28.67 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  27.89 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  32.62 
 
 
396 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  30.9 
 
 
363 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.04 
 
 
429 aa  63.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  27.14 
 
 
1002 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  33.13 
 
 
260 aa  62.4  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  27.73 
 
 
436 aa  62.4  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  29.78 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  30.46 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  28.2 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  35.11 
 
 
406 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  25.24 
 
 
544 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  30.6 
 
 
381 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.17 
 
 
659 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  28.57 
 
 
429 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.3 
 
 
366 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  34.93 
 
 
343 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  26.35 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  31.98 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  30.3 
 
 
414 aa  59.3  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  28.82 
 
 
398 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  24.43 
 
 
451 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  34.13 
 
 
417 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  33.58 
 
 
489 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  30.81 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  29.97 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.69 
 
 
462 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  28.37 
 
 
426 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  30.45 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  29.41 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  24.05 
 
 
518 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  27.84 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  30.37 
 
 
365 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  30.37 
 
 
365 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  30.37 
 
 
365 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  24.59 
 
 
225 aa  56.2  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.01 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.01 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  25.58 
 
 
422 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  28.52 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.01 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.01 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.01 
 
 
364 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.64 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>