More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0603 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  100 
 
 
274 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  95.99 
 
 
274 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  74.22 
 
 
267 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  70.59 
 
 
269 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  69.6 
 
 
269 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  72.06 
 
 
268 aa  357  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  69.96 
 
 
272 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  69.6 
 
 
272 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  69.96 
 
 
276 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  69.6 
 
 
272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  71.48 
 
 
267 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  46.67 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  42.8 
 
 
268 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  44.8 
 
 
275 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  41.67 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  40.81 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  44.14 
 
 
291 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  42.13 
 
 
253 aa  180  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  43.02 
 
 
260 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  42.41 
 
 
253 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.26 
 
 
558 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  43.33 
 
 
291 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  41.92 
 
 
253 aa  175  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  43.12 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  43.12 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  42.75 
 
 
267 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  39.61 
 
 
262 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  37.78 
 
 
307 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  42.91 
 
 
292 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  42.91 
 
 
292 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  38.29 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  37.85 
 
 
275 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  41.6 
 
 
295 aa  158  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  44.53 
 
 
291 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  33.08 
 
 
279 aa  155  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  35.55 
 
 
265 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  40.17 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
270 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  34.83 
 
 
309 aa  152  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  32.28 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  32.28 
 
 
284 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  37.84 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  41.41 
 
 
294 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  37.6 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  40.23 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  36.21 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  39.69 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  42.47 
 
 
264 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  37.31 
 
 
251 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  36.82 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  36.82 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  36.82 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  36.82 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  34.9 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  36.82 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  37.45 
 
 
295 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  38.52 
 
 
251 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  38.13 
 
 
251 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  38.13 
 
 
251 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  38.13 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  37.45 
 
 
295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  38.13 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  34.63 
 
 
281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  37.88 
 
 
267 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  34.63 
 
 
281 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  39.27 
 
 
216 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  38.31 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  36.09 
 
 
297 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  34.5 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  34.54 
 
 
325 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.88 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  33.21 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
267 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
256 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  32.96 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  41.15 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  33.85 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  32.32 
 
 
268 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  33.73 
 
 
269 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  32.87 
 
 
275 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  32.3 
 
 
275 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
263 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
320 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  28.15 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
278 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.52 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  30 
 
 
269 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  30 
 
 
269 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.3 
 
 
283 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.78 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.78 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.78 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.78 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.78 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3790  Methyltransferase type 11  41.15 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>