More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0576 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  65.26 
 
 
810 aa  1094    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  64.76 
 
 
810 aa  1088    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  65.43 
 
 
810 aa  1073    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  65.47 
 
 
808 aa  1082    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  59.21 
 
 
802 aa  944    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  91.81 
 
 
797 aa  1506    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  65.38 
 
 
810 aa  1094    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  100 
 
 
806 aa  1656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.62 
 
 
833 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  41.36 
 
 
806 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  40.44 
 
 
778 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 
829 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  39.53 
 
 
797 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  40.07 
 
 
794 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  38.45 
 
 
828 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  38.3 
 
 
828 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  38.56 
 
 
828 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  39.54 
 
 
820 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  39 
 
 
828 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  39.52 
 
 
729 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  40.32 
 
 
812 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  40.15 
 
 
779 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  38.25 
 
 
815 aa  488  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  37.73 
 
 
817 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  39.77 
 
 
753 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  38.78 
 
 
729 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  40.08 
 
 
723 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  38.48 
 
 
740 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  36.49 
 
 
808 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  41.42 
 
 
769 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  37.16 
 
 
752 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 
797 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  38.72 
 
 
717 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  40.21 
 
 
701 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  38.32 
 
 
801 aa  458  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  37.03 
 
 
747 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  39.68 
 
 
750 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  36.89 
 
 
747 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 
735 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  38.75 
 
 
696 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 
799 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  38.75 
 
 
696 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  37.12 
 
 
747 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  38.27 
 
 
703 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  38.04 
 
 
729 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  39.89 
 
 
741 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  40.11 
 
 
753 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  40.2 
 
 
737 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  38.75 
 
 
696 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  38.13 
 
 
729 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  38.27 
 
 
703 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  36.57 
 
 
747 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  40.11 
 
 
753 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  39.89 
 
 
736 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  38.75 
 
 
696 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  39.89 
 
 
736 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  39.89 
 
 
752 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  38.28 
 
 
696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  36.98 
 
 
747 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  37.12 
 
 
747 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  38.63 
 
 
714 aa  448  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 
705 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  38.6 
 
 
698 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  39.92 
 
 
738 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  37.68 
 
 
729 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  36 
 
 
821 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  36.88 
 
 
819 aa  445  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  39.74 
 
 
754 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  36.88 
 
 
799 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  36.98 
 
 
745 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  37.55 
 
 
733 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 
829 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  39.03 
 
 
789 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 
736 aa  442  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 
748 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  36.24 
 
 
799 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  37.12 
 
 
747 aa  435  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  37.12 
 
 
747 aa  435  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  36.99 
 
 
831 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  36.23 
 
 
724 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 
822 aa  428  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.84 
 
 
689 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  37.84 
 
 
753 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 
699 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  34.32 
 
 
863 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  38.37 
 
 
750 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  39.06 
 
 
745 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 
733 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  37.09 
 
 
701 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  38.13 
 
 
745 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  38.29 
 
 
771 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  38.43 
 
 
771 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  37.29 
 
 
754 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  37.24 
 
 
754 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  37.29 
 
 
754 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 
757 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 
705 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  37.55 
 
 
734 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  37.07 
 
 
719 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  37.62 
 
 
717 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.424895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>