113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0560 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  235  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  62.83 
 
 
131 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  54.92 
 
 
132 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  52.54 
 
 
142 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  51.59 
 
 
130 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  52.1 
 
 
133 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  49.17 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  57.43 
 
 
129 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  55.14 
 
 
130 aa  114  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  60.82 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  52.04 
 
 
386 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  50 
 
 
386 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  48.7 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  45.9 
 
 
124 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  50.86 
 
 
127 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  51.61 
 
 
111 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  51.92 
 
 
114 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  53.1 
 
 
126 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  48.74 
 
 
126 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  54.31 
 
 
128 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  43.59 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  47.79 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  52.68 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  49.12 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  46.49 
 
 
126 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  50.89 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  35.29 
 
 
127 aa  90.1  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  55.37 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  32.48 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  60.29 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  49.43 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  70.51 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  33 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  53.72 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  43.18 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  41.38 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  44.3 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  37.21 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  43.04 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  46.84 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  48.89 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  45.57 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  48.21 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  42.5 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  37.18 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  35.29 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  41.43 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  39.66 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  41.67 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  39.62 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  36.73 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  39.06 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  34.21 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  24.44 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  35.48 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  37.1 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  37.1 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32.14 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  41.27 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  41.27 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  34.48 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  41.27 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  41.27 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  39.68 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  39.68 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  39.68 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  39.68 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  34.67 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  36.56 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  32.69 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  42.19 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  36.73 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  30.26 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  37.68 
 
 
122 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  34.92 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  32 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  37.78 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  37.78 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  37.78 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  37.78 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  37.78 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  38.24 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  37.78 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  37.78 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  57.14 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  34.92 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  39.68 
 
 
121 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  60 
 
 
95 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  38.24 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  30.65 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>