216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0268 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  100 
 
 		 452 aa  897    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  87.61 
 
 		 452 aa  756    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  43.49 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  40.61 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  41.9 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  39.39 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  40.65 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  40.65 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  39.22 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  38.3 
 
 		 448 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  42.16 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  41.06 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  37.58 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  37.58 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  37.58 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  37.58 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  40.14 
 
 		 420 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  37.44 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  37.47 
 
 		 446 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  34.43 
 
 		 425 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  38.29 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  38.74 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  38.35 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  38.8 
 
 		 420 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  39.05 
 
 		 447 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  36.13 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  38.55 
 
 		 420 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  35.96 
 
 		 479 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  36.64 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  36.72 
 
 		 441 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  36.73 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  35.98 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  35.05 
 
 		 427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  35.39 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  34.93 
 
 		 421 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  34.53 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  35.39 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  39.69 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  37.2 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  35.18 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  36.98 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  36.98 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  36.76 
 
 		 448 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  39.45 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  35.95 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  36.18 
 
 		 455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  37.61 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  34.23 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  36.61 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  34.03 
 
 		 429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  36.7 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  34.32 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  34.03 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.03 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  34.03 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  32.48 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  36.7 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  31.15 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  32.72 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  36.47 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  32.41 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  32.41 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  34.38 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  32.68 
 
 		 417 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  34.62 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  32.41 
 
 		 416 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  32.87 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  34.21 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  30.63 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  35.48 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  32.79 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  31.08 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  32.02 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  31.93 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  33.11 
 
 		 421 aa  186  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  32.18 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  31.71 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  33.03 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  30.45 
 
 		 433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  30.94 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  32.48 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  31.4 
 
 		 430 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  30.91 
 
 		 429 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  32.33 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  31.49 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  31.63 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2005  outer membrane porin  31.47 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  32.13 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  32.91 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  32.13 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  33.56 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  30.67 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  30.21 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  30.21 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  29.91 
 
 		 425 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3268  outer membrane porin  30.75 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  0.0282979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  32.37 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  29.69 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  33.64 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  33.57 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>